RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 SSH2Q76I76 1423 aa27.93■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.92■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-215ENST00000532308 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
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TSTA3-215ENST00000532308 NSD2O96028 1365 aa27.88■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 SBNO1A3KN83 1393 aa27.87■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 FYB1O15117 783 aa27.86■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.84■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 ANP32CO43423 234 aa27.84■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 NME9Q86XW9 330 aa27.84■■■□□ 2.05
TSTA3-215ENST00000532308 ABTB2Q8N961 1025 aa27.84■■■□□ 2.05
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TSTA3-215ENST00000532308 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TSTA3-215ENST00000532308 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.82■■■□□ 2.04
TSTA3-215ENST00000532308 PIK3C2AO00443 1686 aa27.81■■■□□ 2.04
TSTA3-215ENST00000532308 ALS2Q96Q42 1657 aa27.81■■■□□ 2.04
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.81■■■□□ 2.04
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TSTA3-215ENST00000532308 COG3Q96JB2 828 aa27.8■■■□□ 2.04
TSTA3-215ENST00000532308 USP31Q70CQ4 1352 aa27.8■■■□□ 2.04
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TSTA3-215ENST00000532308 MORC1Q86VD1 984 aa27.79■■■□□ 2.04
TSTA3-215ENST00000532308 RALBP1Q15311 655 aa27.78■■■□□ 2.04
TSTA3-215ENST00000532308 NLRP13Q86W25 1043 aa27.78■■■□□ 2.04
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TSTA3-215ENST00000532308 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.75■■■□□ 2.03
TSTA3-215ENST00000532308 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.74■■■□□ 2.03
TSTA3-215ENST00000532308 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.74■■■□□ 2.03
TSTA3-215ENST00000532308 FBXO41Q8TF61 875 aa27.74■■■□□ 2.03
TSTA3-215ENST00000532308 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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TSTA3-215ENST00000532308 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.67■■■□□ 2.02
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TSTA3-215ENST00000532308 LTN1O94822 1766 aa27.54■■■□□ 2
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TSTA3-215ENST00000532308 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
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TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.48■■□□□ 1.99
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TSTA3-215ENST00000532308 IP6K1Q92551 441 aa27.45■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 MRS2Q9HD23 443 aa27.45■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 KIAA0232Q92628 1395 aa27.45■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 INSRP06213 1382 aa27.44■■□□□ 1.98
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