RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.38■■■■□ 3.09
PACSIN3-204ENST00000528201 ITSN1Q15811 1721 aa34.38■■■■□ 3.09
PACSIN3-204ENST00000528201 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
PACSIN3-204ENST00000528201 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
PACSIN3-204ENST00000528201 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
PACSIN3-204ENST00000528201 GLI3P10071 1580 aa34.35■■■■□ 3.09
PACSIN3-204ENST00000528201 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.33■■■■□ 3.09
PACSIN3-204ENST00000528201 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.31■■■■□ 3.08
PACSIN3-204ENST00000528201 VPS72Q15906 364 aa34.31■■■■□ 3.08
PACSIN3-204ENST00000528201 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.3■■■■□ 3.08
PACSIN3-204ENST00000528201 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.29■■■■□ 3.08
PACSIN3-204ENST00000528201 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.29■■■■□ 3.08
PACSIN3-204ENST00000528201 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.27■■■■□ 3.08
PACSIN3-204ENST00000528201 BTG4Q9NY30 223 aa34.26■■■■□ 3.08
PACSIN3-204ENST00000528201 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.25■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 EP400Q96L91 3159 aa34.25■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 CABP1Q9NZU7 370 aa34.24■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 TONSLQ96HA7 1378 aa34.23■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 EVC2Q86UK5 1308 aa34.22■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0232Q92628 1395 aa34.21■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.2■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 NRAPQ86VF7 1730 aa34.2■■■■□ 3.07
PACSIN3-204ENST00000528201 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.18■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ABTB2Q8N961 1025 aa34.18■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 CHRNA2Q15822 529 aa34.17■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.17■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 USP19O94966 1318 aa34.16■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 USP6P35125 1406 aa34.15■■■■□ 3.06
PACSIN3-204ENST00000528201 SSH2Q76I76 1423 aa34.13■■■■□ 3.05
PACSIN3-204ENST00000528201 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.11■■■■□ 3.05
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
PACSIN3-204ENST00000528201 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.09■■■■□ 3.05
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.09■■■■□ 3.05
PACSIN3-204ENST00000528201 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.09■■■■□ 3.05
PACSIN3-204ENST00000528201 NLRP13Q86W25 1043 aa34.07■■■■□ 3.04
PACSIN3-204ENST00000528201 GCP02774 474 aa34.05■■■■□ 3.04
PACSIN3-204ENST00000528201 CPDO75976 1380 aa34.05■■■■□ 3.04
PACSIN3-204ENST00000528201 BRWD3Q6RI45 1802 aa34.04■■■■□ 3.04
PACSIN3-204ENST00000528201 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.02■■■■□ 3.04
PACSIN3-204ENST00000528201 STRN4Q9NRL3 753 aa34.02■■■■□ 3.04
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0G2JS52 829 aa34.01■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 NLRP6P59044 892 aa34.01■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 MYT1Q01538 1121 aa34.01■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC125Q86Z20 511 aa33.98■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 PIK3C2AO00443 1686 aa33.97■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 SLIT3O75094 1523 aa33.97■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.96■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
PACSIN3-204ENST00000528201 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa33.93■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 TESK2Q96S53 571 aa33.93■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.93■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 EVA1CP58658 441 aa33.91■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 AKAP12Q02952 1782 aa33.9■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.9■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM182BQ5T319 152 aa33.9■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 USP35Q9P2H5 1018 aa33.9■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC21AQ8NDW8 1320 aa33.89■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.89■■■■□ 3.02
PACSIN3-204ENST00000528201 DEFB132Q7Z7B7 95 aa33.88■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.88■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 TMC1Q8TDI8 760 aa33.87■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.86■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.86■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 BARGINQ6ZT62 677 aa33.84■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.84■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 SOX12O15370 315 aa33.83■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.83■■■■□ 3.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.82■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.82■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa33.81■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 TCP11L2Q8N4U5 519 aa33.81■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 MON2Q7Z3U7 1717 aa33.81■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 NME9Q86XW9 330 aa33.8■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PP64 1363 aa33.79■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 NFAT5O94916 1531 aa33.79■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.78■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 COL18A1P39060 1754 aa33.77■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 USP31Q70CQ4 1352 aa33.77■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 USP47Q96K76 1375 aa33.77■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
PACSIN3-204ENST00000528201 CRB1P82279 1406 aa33.76■■■□□ 2.99
PACSIN3-204ENST00000528201 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
PACSIN3-204ENST00000528201 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
PACSIN3-204ENST00000528201 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.73■■■□□ 2.99
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