RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.43□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 NR6A1Q15406 480 aa8.41□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 BANK1Q8NDB2 785 aa8.41□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 GDF9O60383 454 aa8.4□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 SH3BP2P78314 561 aa8.4□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 BAP1Q92560 729 aa8.4□□□□□ -1.06
CLVS1-209ENST00000522928 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 CTHP32929 405 aa8.39□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.39□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.38□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.38□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 SOCS7O14512 581 aa8.37□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 MCM6Q14566 821 aa8.36□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 LINC01559Q495D7 138 aa8.36□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF511Q8NB15 262 aa8.36□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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CLVS1-209ENST00000522928 WNT7BP56706 349 aa8.35□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 FOXJ1Q92949 421 aa8.35□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 WNT7AO00755 349 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-209ENST00000522928 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 TNFRSF10AO00220 468 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 PRR20EP86478 221 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 PRR20CP86479 221 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 PRR20DP86480 221 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 PRR20BP86481 221 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 PRR20AP86496 221 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 FOXC1Q12948 553 aa8.31□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 IRF5Q13568 498 aa8.3□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.3□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.3□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.29□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 POM121Q96HA1 1249 aa8.29□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.29□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.28□□□□□ -1.08
CLVS1-209ENST00000522928 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 J3QL48 77 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 SMPD1P17405 629 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 NBPF14Q5TI25 921 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 COG6Q9Y2V7 657 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO45P0C2W1 286 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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CLVS1-209ENST00000522928 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 GRM5P41594 1212 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLVS1-209ENST00000522928 MPNDQ8N594 471 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 CDK15Q96Q40 435 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 ADAM32Q8TC27 787 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 FLIIQ13045 1269 aa8.22□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.22□□□□□ -1.09
CLVS1-209ENST00000522928 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.22□□□□□ -1.09
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CLVS1-209ENST00000522928 PTK2Q05397 1052 aa8.21□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 TREML4Q6UXN2 200 aa8.21□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 ZBBXA8MT70 800 aa8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 CYP4X1Q8N118 509 aa8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 ALDH1A1P00352 501 aa8.19□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 AGERQ15109 404 aa8.19□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 HPS1Q92902 700 aa8.19□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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CLVS1-209ENST00000522928 ABL2P42684 1182 aa8.17□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 MYT1Q01538 1121 aa8.17□□□□□ -1.1
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CLVS1-209ENST00000522928 FAM187AA6NFU0 413 aa8.16□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 DGAT1O75907 488 aa8.16□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 ADH1CP00326 375 aa8.16□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB33Q86T24 672 aa8.16□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 ESPNB1AK53 854 aa8.15□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 APBB1O00213 710 aa8.15□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 VAC14Q08AM6 782 aa8.15□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 PNMA1Q8ND90 353 aa8.15□□□□□ -1.1
CLVS1-209ENST00000522928 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CLVS1-209ENST00000522928 ARID5BQ14865 1188 aa8.14□□□□□ -1.11
CLVS1-209ENST00000522928 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.14□□□□□ -1.11
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