RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
MEG3-217ENST00000521404 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
MEG3-217ENST00000521404 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 ACEP12821 1306 aa22.44■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.43■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 ABCA3Q99758 1704 aa22.43■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.42■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 EVC2Q86UK5 1308 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 FAM83GA6ND36 823 aa22.4■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 VPS72Q15906 364 aa22.4■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 CABP2Q9NPB3 220 aa22.4■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.39■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.39■■□□□ 1.18
MEG3-217ENST00000521404 PLEKHG5O94827 1062 aa22.39■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.35■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.34■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 ABTB2Q8N961 1025 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 BTG4Q9NY30 223 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 CABP1Q9NZU7 370 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 GLI3P10071 1580 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-217ENST00000521404 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 NLRP13Q86W25 1043 aa22.31■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 CCDC125Q86Z20 511 aa22.3■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 USP6P35125 1406 aa22.3■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 USP19O94966 1318 aa22.29■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 KIAA0232Q92628 1395 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.27■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 USP47Q96K76 1375 aa22.27■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 NRAPQ86VF7 1730 aa22.27■■□□□ 1.16
MEG3-217ENST00000521404 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.26■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 CPDO75976 1380 aa22.26■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 SLC24A1O60721 1099 aa22.25■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 SSH2Q76I76 1423 aa22.25■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 GCP02774 474 aa22.23■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 NLRP6P59044 892 aa22.22■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.21■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 CHRNA2Q15822 529 aa22.21■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.2■■□□□ 1.15
MEG3-217ENST00000521404 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.2■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.19■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.18■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 EVA1CP58658 441 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 SLIT3O75094 1523 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 A0A0G2JS52 829 aa22.16■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 MYT1Q01538 1121 aa22.16■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.15■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 STRN4Q9NRL3 753 aa22.15■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 AKAP12Q02952 1782 aa22.15■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 TMF1P82094 1093 aa22.14■■□□□ 1.14
MEG3-217ENST00000521404 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.14■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.14■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 PIK3C2AO00443 1686 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 BARGINQ6ZT62 677 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 TESK2Q96S53 571 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 TMC1Q8TDI8 760 aa22.11■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.11■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.11■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 USP31Q70CQ4 1352 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.08■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.08■■□□□ 1.13
MEG3-217ENST00000521404 CDCA8Q53HL2 280 aa22.07■■□□□ 1.12
MEG3-217ENST00000521404 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.07■■□□□ 1.12
MEG3-217ENST00000521404 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MEG3-217ENST00000521404 CRB1P82279 1406 aa22.06■■□□□ 1.12
MEG3-217ENST00000521404 USP35Q9P2H5 1018 aa22.06■■□□□ 1.12
MEG3-217ENST00000521404 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
MEG3-217ENST00000521404 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.04■■□□□ 1.12
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