RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTGDRQ13258 359 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MORN1Q5T089 497 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COL8A1P27658 744 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SKOR1P84550 965 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FUT2Q10981 343 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NLRP7Q8WX94 980 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FECHP22830 423 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRP8Q14114 963 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C6orf118Q5T5N4 469 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDC14CA4D256 554 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BRICD5Q6PL45 260 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD163Q86VB7 1156 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VWA5B2Q8N398 1253 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PXYLP1Q8TE99 480 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUTM2FA1L443 756 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATP6V1AP38606 617 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHRNA4P43681 627 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RDH13Q8NBN7 331 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WDR70Q9NW82 654 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTSQ03393 145 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRIN2CQ14957 1233 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DDX11L8A8MPP1 907 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIAH2O43255 324 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MSS51Q4VC12 460 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SV2AQ7L0J3 742 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC24Q8N4L8 307 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF114Q9Y508 228 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GCGRP47871 477 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MMP16P51512 607 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC155Q8N6L0 562 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HLA-CQ95604 372 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BCRP11274 1271 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TIMP2P16035 220 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WNT7BP56706 349 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PHOX2BQ99453 314 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BMP2P12643 396 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WDR4P57081 412 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EHBP1Q8NDI1 1231 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DXOO77932 396 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCHSD2O94868 740 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OATP04181 439 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NNTQ13423 1086 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GAS6Q14393 721 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RSPH4AQ5TD94 716 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DYRK3O43781 588 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ITGA6P23229 1130 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NKAPLQ5M9Q1 402 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MKL2Q9ULH7 1088 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADH1CP00326 375 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GUCA2AQ02747 115 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CFAP44Q96MT7 982 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TLL2Q9Y6L7 1015 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SH3BP2P78314 561 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEMA3EO15041 775 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GATA4P43694 442 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LINC01559Q495D7 138 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACDQ96AP0 544 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HIC1Q14526 733 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGF1RP08069 1367 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC35F4A4IF30 521 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR37O15354 613 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q3C1V9 767 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BAP1Q92560 729 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms