RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.96□□□□□ -0.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.96□□□□□ -0.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.95□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC102AQ96A19 550 aa10.94□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.93□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DESI1Q6ICB0 168 aa10.92□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRR7Q8TB68 274 aa10.92□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UPP2O95045 317 aa10.91□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.9□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPFIA3O75145 1194 aa10.9□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.9□□□□□ -0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GDF11O95390 407 aa10.89□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GSK3AP49840 483 aa10.89□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDK15Q96Q40 435 aa10.89□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MTMR2Q13614 643 aa10.88□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARID5BQ14865 1188 aa10.88□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BMP2P12643 396 aa10.87□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTHP32929 405 aa10.87□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RASSF7Q02833 373 aa10.87□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NR5A1Q13285 461 aa10.87□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.87□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NDUFV2P19404 249 aa10.86□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ITPKCQ96DU7 683 aa10.86□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.86□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPTLC1O15269 473 aa10.84□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.83□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.83□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AGERQ15109 404 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LYPD8Q6UX82 237 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXJ1Q92949 421 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NR3C2P08235 984 aa10.8□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.8□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.8□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MEIOBQ8N635 442 aa10.79□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GRM5P41594 1212 aa10.78□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.78□□□□□ -0.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLCB2Q00722 1185 aa10.77□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GJA5P36382 358 aa10.76□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRT76Q01546 638 aa10.76□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAP10Q9P2G4 905 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGHA1P01876 353 aa10.73□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.73□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SVOPQ8N4V2 548 aa10.73□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTLL8A6PVC2 850 aa10.72□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTSQ03393 145 aa10.72□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.72□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CFAP99D6REC4 459 aa10.71□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.71□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.71□□□□□ -0.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FSHRP23945 695 aa10.7□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.7□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.7□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.69□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.69□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IRS1P35568 1242 aa10.68□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXK2Q01167 660 aa10.68□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.68□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KANK3Q6NY19 840 aa10.67□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.67□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HRCP23327 699 aa10.66□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.66□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.66□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.66□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLURP2P0DP57 97 aa10.65□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NBPF14Q5TI25 921 aa10.65□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FIGNL2A6NMB9 653 aa10.64□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AMHR2Q16671 573 aa10.64□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.64□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.63□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARHGEF15O94989 841 aa10.62□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SV2AQ7L0J3 742 aa10.62□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.62□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WHAMMQ8TF30 809 aa10.61□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TSC1Q92574 1164 aa10.61□□□□□ -0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms