RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504395.1

RAB24-208, Transcript of RAB24, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB24, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB24-208	ENST00000504395	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.3	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.29	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	CCDC7	Q96M83	1385 aa		28.26	■■■□□ 2.12
RAB24-208	ENST00000504395	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.22	■■■□□ 2.11
RAB24-208	ENST00000504395	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
RAB24-208	ENST00000504395	LRP6	O75581	1613 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RAB24-208	ENST00000504395	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RAB24-208	ENST00000504395	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RAB24-208	ENST00000504395	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RAB24-208	ENST00000504395	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RAB24-208	ENST00000504395	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RAB24-208	ENST00000504395	SLIT3	O75094	1523 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	28.11	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	USP19	O94966	1318 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	NME9	Q86XW9	330 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	PANK3	Q9H999	370 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RAB24-208	ENST00000504395	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	NFAT5	O94916	1531 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	NLRP6	P59044	892 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	NLRP13	Q86W25	1043 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RAB24-208	ENST00000504395	LTN1	O94822	1766 aa		28	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	FYB1	O15117	783 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	ADAMTS2	O95450	1211 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		27.95	■■■□□ 2.07
RAB24-208	ENST00000504395	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	NRAP	Q86VF7	1730 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	GC	P02774	474 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	CPD	O75976	1380 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	NSD2	O96028	1365 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	KIAA0232	Q92628	1395 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	COL18A1	P39060	1754 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	COG3	Q96JB2	828 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	C8orf37	Q96NL8	207 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	RGPD5	Q99666	1765 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	SLIT2	O94813	1529 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RAB24-208	ENST00000504395	ABCC6	O95255	1503 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	SOX12	O15370	315 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	PEAK1	Q9H792	1746 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	FAM83G	A6ND36	823 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	AFF2	P51816	1311 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	NGLY1	Q96IV0	654 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAB24-208	ENST00000504395	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		27.83	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	CHRNA2	Q15822	529 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	FBLN1	P23142	703 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RAB24-208	ENST00000504395	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAB24-208	ENST00000504395	BTG4	Q9NY30	223 aa		27.75	■■■□□ 2.03

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