RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 ORAI2Q96SN7 254 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 PDE4AP27815 886 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 KIF1BO60333 1816 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ROBO1-211ENST00000498428 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.28□□□□□ -0.92
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ROBO1-211ENST00000498428 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.19□□□□□ -0.94
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ROBO1-211ENST00000498428 VGLL3A8MV65 326 aa9.19□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 FYB1O15117 783 aa9.19□□□□□ -0.94
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ROBO1-211ENST00000498428 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.18□□□□□ -0.94
ROBO1-211ENST00000498428 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.18□□□□□ -0.94
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