RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498183.5

GRAMD1C-215, Transcript of GRAM domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene GRAMD1C, Length 735 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1C-215ENST00000498183 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.56■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 HSPA1LP34931 641 aa30.56■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.55■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.54■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 SBNO1A3KN83 1393 aa30.52■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.51■■■□□ 2.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.51■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.49■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 NME9Q86XW9 330 aa30.49■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.49■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.48■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.47■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 ALS2Q96Q42 1657 aa30.46■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 PLEKHG5O94827 1062 aa30.46■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABTB2Q8N961 1025 aa30.46■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.45■■■□□ 2.47
GRAMD1C-215ENST00000498183 PIK3C2AO00443 1686 aa30.44■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 FYB1O15117 783 aa30.43■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.42■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 NLRP6P59044 892 aa30.41■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.41■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.4■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARHGEF10O15013 1369 aa30.39■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.38■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.37■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 USP31Q70CQ4 1352 aa30.36■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 NLRP13Q86W25 1043 aa30.35■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 JCADQ9P266 1359 aa30.35■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.33■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.33■■■□□ 2.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 COG3Q96JB2 828 aa30.32■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 SHPRHQ149N8 1683 aa30.32■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 USP19O94966 1318 aa30.3■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 SOX12O15370 315 aa30.29■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 USP54Q70EL1 1684 aa30.29■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.28■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 NSD2O96028 1365 aa30.28■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 FBLN1P23142 703 aa30.27■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.27■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.27■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 MORC1Q86VD1 984 aa30.26■■■□□ 2.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 SLIT3O75094 1523 aa30.26■■■□□ 2.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCA3Q99758 1704 aa30.25■■■□□ 2.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 GCP02774 474 aa30.24■■■□□ 2.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.2■■■□□ 2.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.19■■■□□ 2.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 NFAT5O94916 1531 aa30.18■■■□□ 2.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 ADAMTS2O95450 1211 aa30.18■■■□□ 2.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRP6O75581 1613 aa30.18■■■□□ 2.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.17■■■□□ 2.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIAA0232Q92628 1395 aa30.14■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.13■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 CHRNA2Q15822 529 aa30.12■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.12■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.11■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.1■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.1■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 FAM83GA6ND36 823 aa30.09■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.09■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 POLKQ9UBT6 870 aa30.09■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 CPDO75976 1380 aa30.08■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 LTN1O94822 1766 aa30.08■■■□□ 2.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPP2R1AP30153 589 aa30.07■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 RALBP1Q15311 655 aa30.07■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 ANP32CO43423 234 aa30.06■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 PEAK1Q9H792 1746 aa30.05■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 AMPHP49418 695 aa30.04■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 C8orf37Q96NL8 207 aa30.03■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 COL18A1P39060 1754 aa30.03■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.02■■■□□ 2.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 MTHFSP49914 203 aa30.01■■■□□ 2.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 HOXC9P31274 260 aa30■■■□□ 2.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 IP6K1Q92551 441 aa30■■■□□ 2.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms