RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 NGLY1Q96IV0 654 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1-207ENST00000497453 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1-207ENST00000497453 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP6P35125 1406 aa25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1-207ENST00000497453 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMF1P82094 1093 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMC1Q8TDI8 760 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABTB2Q8N961 1025 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 SSH2Q76I76 1423 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCA3Q99758 1704 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP21Q9UK80 565 aa25.02■■□□□ 1.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 AKAP12Q02952 1782 aa24.99■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.99■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.98■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 NLRP13Q86W25 1043 aa24.98■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.97■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDCA8Q53HL2 280 aa24.97■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLIT2O94813 1529 aa24.96■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.96■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP19O94966 1318 aa24.96■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM83GA6ND36 823 aa24.96■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.96■■□□□ 1.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.95■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 RXRBP28702 533 aa24.95■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 NLRP6P59044 892 aa24.95■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A1W2PP64 1363 aa24.94■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.94■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.93■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATRNO75882 1429 aa24.93■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.92■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 PIK3C2AO00443 1686 aa24.91■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.91■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIAA0232Q92628 1395 aa24.91■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 GCP02774 474 aa24.9■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.88■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 SOCS7O14512 581 aa24.88■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.88■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLIT3O75094 1523 aa24.87■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 BTG4Q9NY30 223 aa24.87■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 CPDO75976 1380 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHRNA2Q15822 529 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 NME9Q86XW9 330 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP31Q70CQ4 1352 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 VPS72Q15906 364 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 RGS12O14924 1447 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYOM1P52179 1685 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 NRAPQ86VF7 1730 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 SOX12O15370 315 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 GLI3P10071 1580 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP54Q70EL1 1684 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 NFAT5O94916 1531 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 STRN4Q9NRL3 753 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 EVA1CP58658 441 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 FYB1O15117 783 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 COG3Q96JB2 828 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL18A1P39060 1754 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms