RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494546.1

CBX4-203, Transcript of chromobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene CBX4, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-203ENST00000494546 SLIT2O94813 1529 aa47.33■■■■■ 5.17
CBX4-203ENST00000494546 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa47.32■■■■■ 5.17
CBX4-203ENST00000494546 EVC2Q86UK5 1308 aa47.31■■■■■ 5.16
CBX4-203ENST00000494546 UNC5CLQ8IV45 518 aa47.31■■■■■ 5.16
CBX4-203ENST00000494546 CARD11Q9BXL7 1154 aa47.31■■■■■ 5.16
CBX4-203ENST00000494546 RALGAPBQ86X10 1494 aa47.27■■■■■ 5.16
CBX4-203ENST00000494546 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
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CBX4-203ENST00000494546 FAM83GA6ND36 823 aa47.22■■■■■ 5.15
CBX4-203ENST00000494546 CABP1Q9NZU7 370 aa47.22■■■■■ 5.15
CBX4-203ENST00000494546 NUTM2GQ5VZR2 741 aa47.21■■■■■ 5.15
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CBX4-203ENST00000494546 NWD2Q9ULI1 1742 aa47.13■■■■■ 5.13
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CBX4-203ENST00000494546 PRDM11Q9NQV5 511 aa47.08■■■■■ 5.13
CBX4-203ENST00000494546 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa47.08■■■■■ 5.13
CBX4-203ENST00000494546 GLI3P10071 1580 aa47.07■■■■■ 5.13
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CBX4-203ENST00000494546 USP19O94966 1318 aa46.96■■■■■ 5.11
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CBX4-203ENST00000494546 SSH2Q76I76 1423 aa46.91■■■■■ 5.1
CBX4-203ENST00000494546 NLRP6P59044 892 aa46.9■■■■■ 5.1
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CBX4-203ENST00000494546 SEPT12Q8IYM1 358 aa46.89■■■■■ 5.1
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CBX4-203ENST00000494546 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa46.85■■■■■ 5.09
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CBX4-203ENST00000494546 SLC24A1O60721 1099 aa46.72■■■■■ 5.07
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CBX4-203ENST00000494546 KRT27Q7Z3Y8 459 aa46.71■■■■■ 5.07
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CBX4-203ENST00000494546 USP35Q9P2H5 1018 aa46.66■■■■■ 5.06
CBX4-203ENST00000494546 SOX12O15370 315 aa46.65■■■■■ 5.06
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CBX4-203ENST00000494546 A0A1W2PP64 1363 aa46.61■■■■■ 5.05
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CBX4-203ENST00000494546 NME9Q86XW9 330 aa46.59■■■■■ 5.05
CBX4-203ENST00000494546 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.05
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CBX4-203ENST00000494546 ARHGEF25Q86VW2 580 aa46.54■■■■■ 5.04
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CBX4-203ENST00000494546 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
CBX4-203ENST00000494546 TCP11L2Q8N4U5 519 aa46.51■■■■■ 5.04
CBX4-203ENST00000494546 BARGINQ6ZT62 677 aa46.5■■■■■ 5.03
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CBX4-203ENST00000494546 AXIN2Q9Y2T1 843 aa46.48■■■■■ 5.03
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