RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490812.5

PTPN18-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN18, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-215ENST00000490812 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.53■■■□□ 2.48
PTPN18-215ENST00000490812 PLEKHG5O94827 1062 aa30.52■■■□□ 2.48
PTPN18-215ENST00000490812 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 ACEP12821 1306 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 GLI3P10071 1580 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.47■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.47■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.47■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 FAM83GA6ND36 823 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 VPS72Q15906 364 aa30.45■■■□□ 2.47
PTPN18-215ENST00000490812 TONSLQ96HA7 1378 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPN18-215ENST00000490812 CABP2Q9NPB3 220 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPN18-215ENST00000490812 NRAPQ86VF7 1730 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPN18-215ENST00000490812 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PTPN18-215ENST00000490812 EVC2Q86UK5 1308 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPN18-215ENST00000490812 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
PTPN18-215ENST00000490812 BTG4Q9NY30 223 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 ABTB2Q8N961 1025 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 CABP1Q9NZU7 370 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 EP400Q96L91 3159 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPN18-215ENST00000490812 USP6P35125 1406 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 KIAA0232Q92628 1395 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 USP19O94966 1318 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.29■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 NLRP13Q86W25 1043 aa30.28■■■□□ 2.44
PTPN18-215ENST00000490812 SSH2Q76I76 1423 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 CCDC125Q86Z20 511 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 CPDO75976 1380 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 AKAP12Q02952 1782 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.24■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.24■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 CHRNA2Q15822 529 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 PIK3C2AO00443 1686 aa30.2■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.2■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 GCP02774 474 aa30.2■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
PTPN18-215ENST00000490812 SLIT3O75094 1523 aa30.2■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.19■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 NLRP6P59044 892 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 A0A0G2JS52 829 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 MYT1Q01538 1121 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 STRN4Q9NRL3 753 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.14■■■□□ 2.42
PTPN18-215ENST00000490812 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
PTPN18-215ENST00000490812 EVA1CP58658 441 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPN18-215ENST00000490812 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PTPN18-215ENST00000490812 SLC24A1O60721 1099 aa30.09■■■□□ 2.41
PTPN18-215ENST00000490812 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.09■■■□□ 2.41
PTPN18-215ENST00000490812 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPN18-215ENST00000490812 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 TESK2Q96S53 571 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 BARGINQ6ZT62 677 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 TMC1Q8TDI8 760 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 COL18A1P39060 1754 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 USP54Q70EL1 1684 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPN18-215ENST00000490812 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 USP35Q9P2H5 1018 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 USP31Q70CQ4 1352 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 CRB1P82279 1406 aa30■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 NFAT5O94916 1531 aa30■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 USP47Q96K76 1375 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 ABCC6O95255 1503 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
PTPN18-215ENST00000490812 A0A1W2PP64 1363 aa29.97■■■□□ 2.39
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