RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
HOXB3-211ENST00000490677 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
HOXB3-211ENST00000490677 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
HOXB3-211ENST00000490677 FAM83GA6ND36 823 aa40.16■■■■■ 4.02
HOXB3-211ENST00000490677 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.15■■■■■ 4.02
HOXB3-211ENST00000490677 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC61Q9Y6R9 512 aa40.12■■■■■ 4.01
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHG3A1L390 1219 aa40.11■■■■■ 4.01
HOXB3-211ENST00000490677 NEUROD1Q13562 356 aa40.1■■■■■ 4.01
HOXB3-211ENST00000490677 VPS72Q15906 364 aa40.1■■■■■ 4.01
HOXB3-211ENST00000490677 ACEP12821 1306 aa40.1■■■■■ 4.01
HOXB3-211ENST00000490677 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
HOXB3-211ENST00000490677 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.05■■■■■ 4
HOXB3-211ENST00000490677 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa40.02■■■■■ 4
HOXB3-211ENST00000490677 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
HOXB3-211ENST00000490677 CABP2Q9NPB3 220 aa40■■■■□ 3.99
HOXB3-211ENST00000490677 NRKQ7Z2Y5 1582 aa39.99■■■■□ 3.99
HOXB3-211ENST00000490677 BTG4Q9NY30 223 aa39.98■■■■□ 3.99
HOXB3-211ENST00000490677 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
HOXB3-211ENST00000490677 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
HOXB3-211ENST00000490677 SEPT12Q8IYM1 358 aa39.93■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA0232Q92628 1395 aa39.93■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 NUTM2GQ5VZR2 741 aa39.91■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 AKAP12Q02952 1782 aa39.91■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 LMO7Q8WWI1 1683 aa39.89■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa39.89■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 USP19O94966 1318 aa39.89■■■■□ 3.98
HOXB3-211ENST00000490677 PRDM11Q9NQV5 511 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 USP6P35125 1406 aa39.86■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 SSH2Q76I76 1423 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 CABP1Q9NZU7 370 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 PIK3C2AO00443 1686 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 EVC2Q86UK5 1308 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 ABTB2Q8N961 1025 aa39.84■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa39.84■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa39.84■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC125Q86Z20 511 aa39.83■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 CHRNA2Q15822 529 aa39.82■■■■□ 3.97
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa39.8■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 CPDO75976 1380 aa39.79■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa39.78■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 SLIT3O75094 1523 aa39.77■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 KRT27Q7Z3Y8 459 aa39.76■■■■□ 3.96
HOXB3-211ENST00000490677 MON2Q7Z3U7 1717 aa39.74■■■■□ 3.95
HOXB3-211ENST00000490677 TONSLQ96HA7 1378 aa39.74■■■■□ 3.95
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa39.72■■■■□ 3.95
HOXB3-211ENST00000490677 NLRP13Q86W25 1043 aa39.72■■■■□ 3.95
HOXB3-211ENST00000490677 COL18A1P39060 1754 aa39.71■■■■□ 3.95
HOXB3-211ENST00000490677 GCP02774 474 aa39.7■■■■□ 3.95
HOXB3-211ENST00000490677 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
HOXB3-211ENST00000490677 CARD11Q9BXL7 1154 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXB3-211ENST00000490677 STRN4Q9NRL3 753 aa39.66■■■■□ 3.94
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0G2JS52 829 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXB3-211ENST00000490677 MYT1Q01538 1121 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXB3-211ENST00000490677 RGPD1P0DJD0 1748 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXB3-211ENST00000490677 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 NLRP6P59044 892 aa39.62■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.62■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 RGPD5Q99666 1765 aa39.61■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa39.61■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 USP54Q70EL1 1684 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB132Q7Z7B7 95 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa39.59■■■■□ 3.93
HOXB3-211ENST00000490677 FAM182BQ5T319 152 aa39.56■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 AATKQ6ZMQ8 1374 aa39.55■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 BARGINQ6ZT62 677 aa39.54■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 NFAT5O94916 1531 aa39.54■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 EVA1CP58658 441 aa39.53■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 TTC21AQ8NDW8 1320 aa39.53■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 WNK3Q9BYP7 1800 aa39.52■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 USP35Q9P2H5 1018 aa39.51■■■■□ 3.92
HOXB3-211ENST00000490677 ZRANB1Q9UGI0 708 aa39.49■■■■□ 3.91
HOXB3-211ENST00000490677 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
HOXB3-211ENST00000490677 TESK2Q96S53 571 aa39.47■■■■□ 3.91
HOXB3-211ENST00000490677 CRB1P82279 1406 aa39.47■■■■□ 3.91
HOXB3-211ENST00000490677 TCP11L2Q8N4U5 519 aa39.46■■■■□ 3.91
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGEF25Q86VW2 580 aa39.44■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 AXIN2Q9Y2T1 843 aa39.44■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 DISP2A7MBM2 1401 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 USP31Q70CQ4 1352 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 LTN1O94822 1766 aa39.41■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC37A3O60309 1634 aa39.41■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa39.41■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB7CA1YPR0 619 aa39.4■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 PEAK1Q9H792 1746 aa39.4■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 KCNH5Q8NCM2 988 aa39.39■■■■□ 3.9
HOXB3-211ENST00000490677 ABCC6O95255 1503 aa39.39■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms