RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 LINC01559Q495D7 138 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFCD-210ENST00000490205 HPS1Q92902 700 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF511Q8NB15 262 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFCD-210ENST00000490205 TSC1Q92574 1164 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFCD-210ENST00000490205 LILRB3O75022 631 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFCD-210ENST00000490205 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NELFCD-210ENST00000490205 QPCTQ16769 361 aa8.66□□□□□ -1.02
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NELFCD-210ENST00000490205 MAP10Q9P2G4 905 aa8.64□□□□□ -1.03
NELFCD-210ENST00000490205 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.63□□□□□ -1.03
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NELFCD-210ENST00000490205 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
NELFCD-210ENST00000490205 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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NELFCD-210ENST00000490205 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFCD-210ENST00000490205 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NELFCD-210ENST00000490205 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFCD-210ENST00000490205 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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NELFCD-210ENST00000490205 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFCD-210ENST00000490205 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFCD-210ENST00000490205 TRIM47Q96LD4 638 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFCD-210ENST00000490205 FAM117AQ9C073 453 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFCD-210ENST00000490205 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFCD-210ENST00000490205 NNTQ13423 1086 aa8.56□□□□□ -1.04
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NELFCD-210ENST00000490205 TREML4Q6UXN2 200 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFCD-210ENST00000490205 CDK15Q96Q40 435 aa8.55□□□□□ -1.04
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NELFCD-210ENST00000490205 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.54□□□□□ -1.04
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NELFCD-210ENST00000490205 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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NELFCD-210ENST00000490205 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
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NELFCD-210ENST00000490205 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.48□□□□□ -1.05
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NELFCD-210ENST00000490205 AP1G2O75843 785 aa8.47□□□□□ -1.05
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NELFCD-210ENST00000490205 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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NELFCD-210ENST00000490205 ZFP42Q96MM3 310 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFCD-210ENST00000490205 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFCD-210ENST00000490205 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.47□□□□□ -1.05
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NELFCD-210ENST00000490205 NR6A1Q15406 480 aa8.46□□□□□ -1.06
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NELFCD-210ENST00000490205 NEUROD2Q15784 382 aa8.45□□□□□ -1.06
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NELFCD-210ENST00000490205 GOPCQ9HD26 462 aa8.44□□□□□ -1.06
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NELFCD-210ENST00000490205 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 RFC5P40937 340 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 UPP2O95045 317 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 USP17L8P0C7I0 530 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 PTK2Q05397 1052 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFCD-210ENST00000490205 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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