RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 FCHSD2O94868 740 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 STRN4Q9NRL3 753 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 HIP1O00291 1037 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 GNAI2P04899 355 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 PSMA5P28066 241 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 WASHC4Q2M389 1173 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 ZNF428Q96B54 188 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 AKNAQ7Z591 1439 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 SLC4A3P48751 1232 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 CABP4P57796 275 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 TPM1P09493 284 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 FBXW7Q969H0 707 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 CEP89Q96ST8 783 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.62■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 SLC4A2P04920 1241 aa20.62■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 RAD21O60216 631 aa20.61■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 FSD1Q9BTV5 496 aa20.61■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 GSE1Q14687 1217 aa20.61■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.6■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-213ENST00000489895 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 BICD2Q8TD16 824 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 CCDC27Q2M243 656 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 NCOA1Q15788 1441 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 XBP1P17861 261 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 MCM2P49736 904 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 NFE2L2Q16236 605 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 WDR97A6NE52 1622 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 FANCAO15360 1455 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-213ENST00000489895 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 BCAR3O75815 825 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.876e-7■■■□□ 17.7
NISCH-213ENST00000489895 BTBD11A6QL63 1104 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 FAM177BA6PVY3 158 aa20.49■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 RABEP1Q15276 862 aa20.49■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 PDCP20941 246 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 FYB1O15117 783 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 IDI1Q13907 227 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 ABCC11Q96J66 1382 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NISCH-213ENST00000489895 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.45■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 KLHL34Q8N239 644 aa20.45■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.45■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.44■□□□□ 0.86
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