RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 BTG4Q9NY30 223 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 CDK19Q9BWU1 502 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 ACEP12821 1306 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0G2JS52 829 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-210ENST00000489601 MYT1Q01538 1121 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA0232Q92628 1395 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-210ENST00000489601 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-210ENST00000489601 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-210ENST00000489601 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-210ENST00000489601 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 CHRNA2Q15822 529 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 ABTB2Q8N961 1025 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 BAG6P46379 1132 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 CABP2Q9NPB3 220 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 USP19O94966 1318 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 STRN4Q9NRL3 753 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 CPDO75976 1380 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRP13Q86W25 1043 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM182BQ5T319 152 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 SSH2Q76I76 1423 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 EVA1CP58658 441 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 GCP02774 474 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 BARGINQ6ZT62 677 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 CABP1Q9NZU7 370 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 DISP2A7MBM2 1401 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-210ENST00000489601 USP6P35125 1406 aa23.83■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 USP35Q9P2H5 1018 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 EVC2Q86UK5 1308 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 LRP5O75197 1615 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRP6P59044 892 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 PDE3BQ13370 1112 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 NEUROD1Q13562 356 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 SLIT3O75094 1523 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIM37O94972 964 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PIK3C2AO00443 1686 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 AKAP12Q02952 1782 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 CRB1P82279 1406 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 COL18A1P39060 1754 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 APBA3O96018 575 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-210ENST00000489601 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RREB1Q92766 1687 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 RGPD5Q99666 1765 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP4-210ENST00000489601 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 PEAK1Q9H792 1746 aa23.64■■□□□ 1.37
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