RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.54■■■□□ 2.8
POLR2F-211ENST00000488684 BTG4Q9NY30 223 aa32.54■■■□□ 2.8
POLR2F-211ENST00000488684 ITSN1Q15811 1721 aa32.52■■■□□ 2.8
POLR2F-211ENST00000488684 NRAPQ86VF7 1730 aa32.51■■■□□ 2.8
POLR2F-211ENST00000488684 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa32.51■■■□□ 2.8
POLR2F-211ENST00000488684 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
POLR2F-211ENST00000488684 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
POLR2F-211ENST00000488684 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.46■■■□□ 2.79
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.46■■■□□ 2.79
POLR2F-211ENST00000488684 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.45■■■□□ 2.79
POLR2F-211ENST00000488684 ACEP12821 1306 aa32.45■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.44■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.43■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.43■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.42■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 NUTM2GQ5VZR2 741 aa32.41■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 DEFB132Q7Z7B7 95 aa32.41■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 A0A0G2JS52 829 aa32.39■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 MYT1Q01538 1121 aa32.39■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.39■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa32.39■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa32.39■■■□□ 2.78
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA0232Q92628 1395 aa32.38■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 CHRNA2Q15822 529 aa32.37■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.35■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 CABP2Q9NPB3 220 aa32.34■■■□□ 2.77
POLR2F-211ENST00000488684 ABTB2Q8N961 1025 aa32.31■■■□□ 2.76
POLR2F-211ENST00000488684 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa32.3■■■□□ 2.76
POLR2F-211ENST00000488684 FAM182BQ5T319 152 aa32.29■■■□□ 2.76
POLR2F-211ENST00000488684 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa32.28■■■□□ 2.76
POLR2F-211ENST00000488684 QRICH2Q9H0J4 1663 aa32.28■■■□□ 2.76
POLR2F-211ENST00000488684 STRN4Q9NRL3 753 aa32.28■■■□□ 2.76
POLR2F-211ENST00000488684 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.27■■■□□ 2.76
POLR2F-211ENST00000488684 NEUROD1Q13562 356 aa32.25■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 USP19O94966 1318 aa32.25■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 CABP1Q9NZU7 370 aa32.24■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32.24■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa32.22■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 NLRP13Q86W25 1043 aa32.21■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.21■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 CPDO75976 1380 aa32.2■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 BAG6P46379 1132 aa32.2■■■□□ 2.75
POLR2F-211ENST00000488684 GCP02774 474 aa32.19■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 EVA1CP58658 441 aa32.19■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 SSH2Q76I76 1423 aa32.18■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 USP35Q9P2H5 1018 aa32.18■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 LMO7Q8WWI1 1683 aa32.16■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 USP6P35125 1406 aa32.16■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 EVC2Q86UK5 1308 aa32.15■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 RGPD1P0DJD0 1748 aa32.14■■■□□ 2.74
POLR2F-211ENST00000488684 BARGINQ6ZT62 677 aa32.13■■■□□ 2.73
POLR2F-211ENST00000488684 NLRP6P59044 892 aa32.11■■■□□ 2.73
POLR2F-211ENST00000488684 FAM196AQ6ZSG2 479 aa32.09■■■□□ 2.73
POLR2F-211ENST00000488684 TCP11L2Q8N4U5 519 aa32.09■■■□□ 2.73
POLR2F-211ENST00000488684 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
POLR2F-211ENST00000488684 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM37O94972 964 aa32.07■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 DISP2A7MBM2 1401 aa32.06■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 SLIT3O75094 1523 aa32.05■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 ZBTB7CA1YPR0 619 aa32.04■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 PDE3BQ13370 1112 aa32.04■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 PIK3C2AO00443 1686 aa32.04■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.02■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa32.01■■■□□ 2.72
POLR2F-211ENST00000488684 CAMKK2Q96RR4 588 aa32■■■□□ 2.71
POLR2F-211ENST00000488684 AKAP12Q02952 1782 aa31.99■■■□□ 2.71
POLR2F-211ENST00000488684 COL18A1P39060 1754 aa31.98■■■□□ 2.71
POLR2F-211ENST00000488684 CRB1P82279 1406 aa31.98■■■□□ 2.71
POLR2F-211ENST00000488684 APBA3O96018 575 aa31.97■■■□□ 2.71
POLR2F-211ENST00000488684 AXIN2Q9Y2T1 843 aa31.97■■■□□ 2.71
POLR2F-211ENST00000488684 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
POLR2F-211ENST00000488684 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 LRP5O75197 1615 aa31.93■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGEF25Q86VW2 580 aa31.93■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.93■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 TTC21AQ8NDW8 1320 aa31.92■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.92■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 SOX12O15370 315 aa31.9■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa31.9■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 KCNH5Q8NCM2 988 aa31.89■■■□□ 2.7
POLR2F-211ENST00000488684 WDR17Q8IZU2 1322 aa31.88■■■□□ 2.69
POLR2F-211ENST00000488684 PARD3Q8TEW0 1356 aa31.87■■■□□ 2.69
POLR2F-211ENST00000488684 RGPD5Q99666 1765 aa31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms