RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF10O15013 1369 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 TMC1Q8TDI8 760 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 USP6P35125 1406 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 AFF2P51816 1311 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 TMF1P82094 1093 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 NGLY1Q96IV0 654 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-210ENST00000488157 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 SSH2Q76I76 1423 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 ABTB2Q8N961 1025 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 PIK3C2AO00443 1686 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 FAM83GA6ND36 823 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 SLC24A1O60721 1099 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 A0A1W2PP64 1363 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 USP21Q9UK80 565 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-210ENST00000488157 NLRP6P59044 892 aa16.95■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 NLRP13Q86W25 1043 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 MYOM1P52179 1685 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 USP19O94966 1318 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 NME9Q86XW9 330 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 SLIT2O94813 1529 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 CHRNA2Q15822 529 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 KIAA0232Q92628 1395 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 GCP02774 474 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 CDCA8Q53HL2 280 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.89■□□□□ 0.3
NISCH-210ENST00000488157 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 SOX12O15370 315 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 SLIT3O75094 1523 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 ATRNO75882 1429 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 RXRBP28702 533 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 BTG4Q9NY30 223 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.87■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.87■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 NRAPQ86VF7 1730 aa16.87■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 USP31Q70CQ4 1352 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 CPDO75976 1380 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 USP54Q70EL1 1684 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-210ENST00000488157 FYB1O15117 783 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 NFAT5O94916 1531 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 GLI3P10071 1580 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 FBLN1P23142 703 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 COL18A1P39060 1754 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 VPS72Q15906 364 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 STRN4Q9NRL3 753 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 RGPD5Q99666 1765 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 RGS12O14924 1447 aa16.81■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.81■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.81■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.81■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 PANK3Q9H999 370 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.8■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 SOCS7O14512 581 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 EVA1CP58658 441 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 COG3Q96JB2 828 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 LTN1O94822 1766 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms