RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CABP1Q9NZU7 370 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ALS2Q96Q42 1657 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC24A1O60721 1099 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABTB2Q8N961 1025 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP47Q96K76 1375 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABCA3Q99758 1704 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP6P35125 1406 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATRNO75882 1429 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMC1Q8TDI8 760 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLIT2O94813 1529 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NLRP13Q86W25 1043 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM83GA6ND36 823 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TESK2Q96S53 571 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NLRP6P59044 892 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMF1P82094 1093 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BTG4Q9NY30 223 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RGS12O14924 1447 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KIAA0232Q92628 1395 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP19O94966 1318 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VPS72Q15906 364 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CDCA8Q53HL2 280 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SSH2Q76I76 1423 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GCP02774 474 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHRNA2Q15822 529 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AKAP12Q02952 1782 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CPDO75976 1380 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PIK3C2AO00443 1686 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EVA1CP58658 441 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1W2PP64 1363 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A0G2JS52 829 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYT1Q01538 1121 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STRN4Q9NRL3 753 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GLI3P10071 1580 aa27.57■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SOX12O15370 315 aa27.57■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLIT3O75094 1523 aa27.57■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NRAPQ86VF7 1730 aa27.56■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NME9Q86XW9 330 aa27.54■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.54■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.53■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.53■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.52■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP31Q70CQ4 1352 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP35Q9P2H5 1018 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COG3Q96JB2 828 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NFAT5O94916 1531 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EP400Q96L91 3159 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms