RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 H3BM21 787 aa8.4□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 SCARF1Q14162 830 aa8.4□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 TIMP2P16035 220 aa8.38□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 ADH1CP00326 375 aa8.37□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 AGERQ15109 404 aa8.37□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.37□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 FOXJ1Q92949 421 aa8.37□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 MAP10Q9P2G4 905 aa8.37□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.36□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.36□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.36□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 TSC1Q92574 1164 aa8.36□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.36□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.35□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.35□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.35□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.35□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 CFAP99D6REC4 459 aa8.34□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 MAN1A2O60476 641 aa8.34□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SENP6-210ENST00000487548 DESI1Q6ICB0 168 aa8.33□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 ITPKCQ96DU7 683 aa8.33□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 LYPD8Q6UX82 237 aa8.32□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.32□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 NR3C2P08235 984 aa8.31□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 AMHR2Q16671 573 aa8.31□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 BARGINQ6ZT62 677 aa8.31□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 BMP2P12643 396 aa8.3□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 HRCP23327 699 aa8.3□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 MPNDQ8N594 471 aa8.29□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.29□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 ZMYND10O75800 440 aa8.28□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.28□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.28□□□□□ -1.08
SENP6-210ENST00000487548 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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SENP6-210ENST00000487548 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.27□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 CDK15Q96Q40 435 aa8.27□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 SPTLC1O15269 473 aa8.26□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 FSHRP23945 695 aa8.26□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.26□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.25□□□□□ -1.09
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SENP6-210ENST00000487548 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.25□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 PPFIA3O75145 1194 aa8.24□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.24□□□□□ -1.09
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SENP6-210ENST00000487548 GJA5P36382 358 aa8.23□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 QPCTQ16769 361 aa8.23□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.23□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 TRIM66O15016 1216 aa8.22□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 MEIOBQ8N635 442 aa8.22□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.22□□□□□ -1.09
SENP6-210ENST00000487548 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.2□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 NBPF14Q5TI25 921 aa8.18□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.18□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.18□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.18□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.18□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.18□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 TTLL8A6PVC2 850 aa8.17□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 CBLBQ13191 982 aa8.17□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.17□□□□□ -1.1
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SENP6-210ENST00000487548 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 AK7Q96M32 723 aa8.16□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.16□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.16□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 KRT76Q01546 638 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 PTSQ03393 145 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP6-210ENST00000487548 LILRB3O75022 631 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP6-210ENST00000487548 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP6-210ENST00000487548 ERFEQ4G0M1 354 aa8.13□□□□□ -1.11
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SENP6-210ENST00000487548 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SENP6-210ENST00000487548 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.13□□□□□ -1.11
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