RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486667.5

SRSF11-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 11, human

TSL 5

Gene SRSF11, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF11-215	ENST00000486667	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	DCC	P43146	1447 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	NME9	Q86XW9	330 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	COG3	Q96JB2	828 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	SOCS7	O14512	581 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SRSF11-215	ENST00000486667	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	ATF3	P18847	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	MST1R	Q04912	1400 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	MSH6	P52701	1360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SRSF11-215	ENST00000486667	PSME1	Q06323	249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	APAF1	O14727	1248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	4e-17	■■■■■ 41.2
SRSF11-215	ENST00000486667	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	PEAK1	Q9H792	1746 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	FCHSD2	O94868	740 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	FBLN1	P23142	703 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	IL13	P35225	146 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	NLRP6	P59044	892 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	FOXO3	O43524	673 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	LTN1	O94822	1766 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	FLT4	P35916	1363 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	SLIT3	O75094	1523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	NFAT5	O94916	1531 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SRSF11-215	ENST00000486667	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	USP19	O94966	1318 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SRSF11-215	ENST00000486667	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms