RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, human

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NBPF3-211	ENST00000485941	BTG4	Q9NY30	223 aa		34.12	■■■■□ 3.05
NBPF3-211	ENST00000485941	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	34.12	■■■■□ 3.05
NBPF3-211	ENST00000485941	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	34.11	■■■■□ 3.05
NBPF3-211	ENST00000485941	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
NBPF3-211	ENST00000485941	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
NBPF3-211	ENST00000485941	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	34.05	■■■■□ 3.04
NBPF3-211	ENST00000485941	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		34.04	■■■■□ 3.04
NBPF3-211	ENST00000485941	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		34.04	■■■■□ 3.04
NBPF3-211	ENST00000485941	ITSN1	Q15811	1721 aa		34.02	■■■■□ 3.04
NBPF3-211	ENST00000485941	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.04
NBPF3-211	ENST00000485941	CDK19	Q9BWU1	502 aa		34.01	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.99	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	33.99	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.99	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.99	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.98	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		33.96	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.96	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.96	■■■■□ 3.03
NBPF3-211	ENST00000485941	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.94	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.94	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.94	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	ACE	P12821	1306 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.91	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941		A0A0G2JS52	829 aa		33.9	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	MYT1	Q01538	1121 aa		33.9	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.89	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.89	■■■■□ 3.02
NBPF3-211	ENST00000485941	BAG6	P46379	1132 aa		33.87	■■■■□ 3.01
NBPF3-211	ENST00000485941	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.85	■■■■□ 3.01
NBPF3-211	ENST00000485941	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.85	■■■■□ 3.01
NBPF3-211	ENST00000485941	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
NBPF3-211	ENST00000485941	USP19	O94966	1318 aa		33.83	■■■■□ 3.01
NBPF3-211	ENST00000485941	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.83	■■■■□ 3.01
NBPF3-211	ENST00000485941	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.83	■■■■□ 3.01
NBPF3-211	ENST00000485941	LRP5	O75197	1615 aa		33.82	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	CPD	O75976	1380 aa		33.81	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.8	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.79	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.79	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.78	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.77	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.77	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
NBPF3-211	ENST00000485941	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		33.76	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	CABP2	Q9NPB3	220 aa		33.73	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.72	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	GC	P02774	474 aa		33.71	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.71	■■■□□ 2.99
NBPF3-211	ENST00000485941	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.69	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.69	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.68	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	TRIM37	O94972	964 aa		33.67	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	EVA1C	P58658	441 aa		33.67	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.67	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	USP6	P35125	1406 aa		33.66	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.65	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.65	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
NBPF3-211	ENST00000485941	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
NBPF3-211	ENST00000485941	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
NBPF3-211	ENST00000485941	SLIT3	O75094	1523 aa		33.62	■■■□□ 2.97
NBPF3-211	ENST00000485941	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.6	■■■□□ 2.97
NBPF3-211	ENST00000485941	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.58	■■■□□ 2.97
NBPF3-211	ENST00000485941	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.58	■■■□□ 2.97
NBPF3-211	ENST00000485941	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.58	■■■□□ 2.97
NBPF3-211	ENST00000485941	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	APBA3	O96018	575 aa		33.57	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.57	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	RREB1	Q92766	1687 aa		33.55	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	COL18A1	P39060	1754 aa		33.55	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	NLRP6	P59044	892 aa		33.55	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.55	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	CRB1	P82279	1406 aa		33.54	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	EVC2	Q86UK5	1308 aa		33.52	■■■□□ 2.96
NBPF3-211	ENST00000485941	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.5	■■■□□ 2.95
NBPF3-211	ENST00000485941	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.49	■■■□□ 2.95
NBPF3-211	ENST00000485941	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.48	■■■□□ 2.95
NBPF3-211	ENST00000485941	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.47	■■■□□ 2.95
NBPF3-211	ENST00000485941	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
NBPF3-211	ENST00000485941	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.45	■■■□□ 2.95
NBPF3-211	ENST00000485941	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
NBPF3-211	ENST00000485941	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.44	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.43	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.39	■■■□□ 2.94
NBPF3-211	ENST00000485941	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.38	■■■□□ 2.93

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