RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485896.5

C1orf35-205, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 1,429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-205ENST00000485896 NGLY1Q96IV0 654 aa29.3■■■□□ 2.28
C1orf35-205ENST00000485896 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-205ENST00000485896 USP6P35125 1406 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf35-205ENST00000485896 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf35-205ENST00000485896 TMC1Q8TDI8 760 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf35-205ENST00000485896 AKAP12Q02952 1782 aa29.22■■■□□ 2.27
C1orf35-205ENST00000485896 ABTB2Q8N961 1025 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf35-205ENST00000485896 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf35-205ENST00000485896 SLC24A1O60721 1099 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 TMF1P82094 1093 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 USP21Q9UK80 565 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 SSH2Q76I76 1423 aa29.16■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf35-205ENST00000485896 PIK3C2AO00443 1686 aa29.13■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 SLIT2O94813 1529 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 RXRBP28702 533 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 A0A1W2PP64 1363 aa29.1■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 FAM83GA6ND36 823 aa29.1■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 NLRP6P59044 892 aa29.1■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 NLRP13Q86W25 1043 aa29.1■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 USP19O94966 1318 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
C1orf35-205ENST00000485896 KIAA0232Q92628 1395 aa29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 CDCA8Q53HL2 280 aa29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 ATRNO75882 1429 aa29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.06■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.06■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 SOCS7O14512 581 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 CHRNA2Q15822 529 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 GCP02774 474 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 BTG4Q9NY30 223 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-205ENST00000485896 SLIT3O75094 1523 aa29.01■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 NRAPQ86VF7 1730 aa29■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 NME9Q86XW9 330 aa29■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 POLR3GLQ9BT43 218 aa29■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 MYOM1P52179 1685 aa28.99■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.99■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 SOX12O15370 315 aa28.98■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 RGS12O14924 1447 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 CPDO75976 1380 aa28.96■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
C1orf35-205ENST00000485896 VPS72Q15906 364 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 GLI3P10071 1580 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 USP31Q70CQ4 1352 aa28.92■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 USP54Q70EL1 1684 aa28.92■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 STRN4Q9NRL3 753 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.89■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 NFAT5O94916 1531 aa28.89■■■□□ 2.22
C1orf35-205ENST00000485896 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.88■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.88■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 EP400Q96L91 3159 aa28.85■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 EVA1CP58658 441 aa28.85■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.84■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.84■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.84■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.84■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 COG3Q96JB2 828 aa28.83■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.83■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.83■■■□□ 2.21
C1orf35-205ENST00000485896 COL18A1P39060 1754 aa28.83■■■□□ 2.2
C1orf35-205ENST00000485896 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
C1orf35-205ENST00000485896 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.81■■■□□ 2.2
C1orf35-205ENST00000485896 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.81■■■□□ 2.2
C1orf35-205ENST00000485896 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
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