RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 QPCTQ16769 361 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 FAM117AQ9C073 453 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 WNT7AO00755 349 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 CTHP32929 405 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 NEUROD2Q15784 382 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 LILRB3O75022 631 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 WNT7BP56706 349 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 KCNH2Q12809 1159 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 KIFC2Q96AC6 838 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM47Q96LD4 638 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 SMPD1P17405 629 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 SKOR1P84550 965 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 LYPD8Q6UX82 237 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-211ENST00000484135 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01559Q495D7 138 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 MAP10Q9P2G4 905 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 SH3BP2P78314 561 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 BAP1Q92560 729 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 J3QL48 77 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF511Q8NB15 262 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH1A1P00352 501 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 HPS1Q92902 700 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 LCE2CQ5TA81 110 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 IL27Q8NEV9 243 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 AGERQ15109 404 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 IRF7Q92985 503 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 AP1G2O75843 785 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 SIAH2O43255 324 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF14Q5TI25 921 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 FOXJ1Q92949 421 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-211ENST00000484135 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 GOPCQ9HD26 462 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 GMPRP36959 345 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 RFC5P40937 340 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L8P0C7I0 530 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 ARID5BQ14865 1188 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 NR6A1Q15406 480 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-211ENST00000484135 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 NNTQ13423 1086 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 BMP1P13497 986 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 MPNDQ8N594 471 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 ADH1CP00326 375 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 VEGFBP49765 207 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 PNMA1Q8ND90 353 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 H3BM21 787 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 CDK15Q96Q40 435 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-211ENST00000484135 FSHRP23945 695 aa9.27□□□□□ -0.93
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