RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC24A1O60721 1099 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP4-209ENST00000484097 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SH3BP4-209ENST00000484097 ALS2Q96Q42 1657 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP4-209ENST00000484097 RXRBP28702 533 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP4-209ENST00000484097 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP4-209ENST00000484097 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SH3BP4-209ENST00000484097 ABTB2Q8N961 1025 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 USP47Q96K76 1375 aa27.09■■□□□ 1.93
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SH3BP4-209ENST00000484097 TMC1Q8TDI8 760 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCA3Q99758 1704 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 TESK2Q96S53 571 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-209ENST00000484097 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 USP6P35125 1406 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 NLRP13Q86W25 1043 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM83GA6ND36 823 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 TMF1P82094 1093 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 AKAP12Q02952 1782 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-209ENST00000484097 SLIT2O94813 1529 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 NLRP6P59044 892 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 ATRNO75882 1429 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM11Q9NQV5 511 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.99■■□□□ 1.91
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SH3BP4-209ENST00000484097 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.97■■□□□ 1.91
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SH3BP4-209ENST00000484097 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 CDCA8Q53HL2 280 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 BTG4Q9NY30 223 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.97■■□□□ 1.91
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SH3BP4-209ENST00000484097 SSH2Q76I76 1423 aa26.96■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA0232Q92628 1395 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 USP19O94966 1318 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 GCP02774 474 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CHRNA2Q15822 529 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 VPS72Q15906 364 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 RGS12O14924 1447 aa26.89■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 PIK3C2AO00443 1686 aa26.89■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PP64 1363 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 EVA1CP58658 441 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 CPDO75976 1380 aa26.86■■□□□ 1.89
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SH3BP4-209ENST00000484097 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 STRN4Q9NRL3 753 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 NRAPQ86VF7 1730 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 SOX12O15370 315 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 NME9Q86XW9 330 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 SLIT3O75094 1523 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-209ENST00000484097 GLI3P10071 1580 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 USP31Q70CQ4 1352 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JS52 829 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 MYT1Q01538 1121 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-209ENST00000484097 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.73■■□□□ 1.87
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SH3BP4-209ENST00000484097 USP35Q9P2H5 1018 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 USP54Q70EL1 1684 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP4-209ENST00000484097 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-209ENST00000484097 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-209ENST00000484097 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-209ENST00000484097 NFAT5O94916 1531 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-209ENST00000484097 COL18A1P39060 1754 aa26.68■■□□□ 1.86
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