RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 FOXO3O43524 673 aa17.83■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa17.82■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 PXDNQ92626 1479 aa17.82■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 KRT28Q7Z3Y7 464 aa17.81■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.79■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 USP54Q70EL1 1684 aa17.79■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 TNS3Q68CZ2 1445 aa17.78■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 ARHGEF10O15013 1369 aa17.78■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 USP31Q70CQ4 1352 aa17.78■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa17.77■□□□□ 0.44
NISCH-208ENST00000481211 FYB1O15117 783 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 ALS2Q96Q42 1657 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 PIK3C2AO00443 1686 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 PIP4K2BP78356 416 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 RALBP1Q15311 655 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 OVOS2Q6IE36 1432 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 ANP32CO43423 234 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 ABTB2Q8N961 1025 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 PHLPP1O60346 1717 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 NLRP13Q86W25 1043 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 COG3Q96JB2 828 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 NME9Q86XW9 330 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 MORC1Q86VD1 984 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-208ENST00000481211 NLRP6P59044 892 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 USP19O94966 1318 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 AATKQ6ZMQ8 1374 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 SLIT3O75094 1523 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 KCNH5Q8NCM2 988 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.66■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 KIF24Q5T7B8 1368 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-208ENST00000481211 SHPRHQ149N8 1683 aa17.64■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 PNPLA6Q8IY17 1366 aa17.64■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 JCADQ9P266 1359 aa17.64■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.64■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 FBXO41Q8TF61 875 aa17.63■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 NFAT5O94916 1531 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 GCP02774 474 aa17.61■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 NUTM2GQ5VZR2 741 aa17.61■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 ABCC6O95255 1503 aa17.61■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 CCER2I3L3R5 266 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 PPP2R1AP30153 589 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 RTL1A6NKG5 1358 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 ABCA3Q99758 1704 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 CPDO75976 1380 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
NISCH-208ENST00000481211 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 HSPA1LP34931 641 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 INSRP06213 1382 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 ARHGEF25Q86VW2 580 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 CFAP53Q96M91 514 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 POLKQ9UBT6 870 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 FLT4P35916 1363 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 MAP3K19Q56UN5 1328 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 MTHFSP49914 203 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 MIER1Q8N108 512 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 LTN1O94822 1766 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 SOX12O15370 315 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 AMPHP49418 695 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 CABLES1Q8TDN4 633 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-208ENST00000481211 IP6K1Q92551 441 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 KIAA0232Q92628 1395 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 PRDM11Q9NQV5 511 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 PEAK1Q9H792 1746 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 HOXC9P31274 260 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 FBLN1P23142 703 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 MRS2Q9HD23 443 aa17.48■□□□□ 0.39
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