RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SYF2-203ENST00000474160 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SYF2-203ENST00000474160 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
SYF2-203ENST00000474160 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SYF2-203ENST00000474160 POTEAQ6S8J7 498 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-203ENST00000474160 USP6P35125 1406 aa26.62■■□□□ 1.85
SYF2-203ENST00000474160 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.61■■□□□ 1.85
SYF2-203ENST00000474160 ABCA3Q99758 1704 aa26.59■■□□□ 1.85
SYF2-203ENST00000474160 TMF1P82094 1093 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-203ENST00000474160 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 CDCA8Q53HL2 280 aa26.57■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 SSH2Q76I76 1423 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 USP21Q9UK80 565 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 ABTB2Q8N961 1025 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 AKAP12Q02952 1782 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 NLRP13Q86W25 1043 aa26.54■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 SLIT2O94813 1529 aa26.54■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 SOCS7O14512 581 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 RXRBP28702 533 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SYF2-203ENST00000474160 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.51■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 USP19O94966 1318 aa26.51■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.51■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 ATRNO75882 1429 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 TMC1Q8TDI8 760 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.48■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.48■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.46■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.46■■□□□ 1.83
SYF2-203ENST00000474160 FAM83GA6ND36 823 aa26.45■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 CPDO75976 1380 aa26.45■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 NLRP6P59044 892 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHG5O94827 1062 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 PIK3C2AO00443 1686 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 GCP02774 474 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 SLIT3O75094 1523 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 A0A1W2PP64 1363 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 VPS72Q15906 364 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 USP31Q70CQ4 1352 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0232Q92628 1395 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SYF2-203ENST00000474160 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SYF2-203ENST00000474160 BTG4Q9NY30 223 aa26.37■■□□□ 1.81
SYF2-203ENST00000474160 USP54Q70EL1 1684 aa26.37■■□□□ 1.81
SYF2-203ENST00000474160 NRAPQ86VF7 1730 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-203ENST00000474160 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SYF2-203ENST00000474160 RGS12O14924 1447 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.31■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 CHRNA2Q15822 529 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 ABCC6O95255 1503 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 GLI3P10071 1580 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 NME9Q86XW9 330 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-203ENST00000474160 MYOM1P52179 1685 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 NFAT5O94916 1531 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.25■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 EVA1CP58658 441 aa26.24■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 COG3Q96JB2 828 aa26.23■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-203ENST00000474160 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.2■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 STRN4Q9NRL3 753 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 COL18A1P39060 1754 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 FYB1O15117 783 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 BARGINQ6ZT62 677 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 CRB1P82279 1406 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 SOX12O15370 315 aa26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms