RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 SSH2Q76I76 1423 aa21.8■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 C14orf37Q86TY3 774 aa21.79■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 COG3Q96JB2 828 aa21.79■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.79■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.77■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.77■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.76■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 SHPRHQ149N8 1683 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 STRCQ7RTU9 1775 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 POLKQ9UBT6 870 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.72■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 FBLN1P23142 703 aa21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 PDE3BQ13370 1112 aa21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 NUDCQ9Y266 331 aa21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 TMEM94Q12767 1356 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.69■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 USP31Q70CQ4 1352 aa21.68■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 APAF1O14727 1248 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 NGEFQ8N5V2 710 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 RUNDC1Q96C34 613 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 DCCP43146 1447 aa21.65■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 ORAI2Q96SN7 254 aa21.64■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ATF3P18847 181 aa21.64■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PSME1Q06323 249 aa21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ZNF521Q96K83 1311 aa21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PIK3C2AO00443 1686 aa21.62■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 NLRP6P59044 892 aa21.62■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ABTB2Q8N961 1025 aa21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 MST1RQ04912 1400 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 IL13P35225 146 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 MSH6P52701 1360 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 FOXO3O43524 673 aa21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 USP54Q70EL1 1684 aa21.57■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 FCHSD2O94868 740 aa21.57■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.57■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 NEFLP07196 543 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 GOLGA2Q08379 1002 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 KIF1AQ12756 1690 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.55■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.54■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 SOX12O15370 315 aa21.53■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 CCDC27Q2M243 656 aa21.53■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 WWC1Q8IX03 1113 aa21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 FKBP8Q14318 412 aa21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 SBNO1A3KN83 1393 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 SLFN5Q08AF3 891 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 PEAK1Q9H792 1746 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 NEUROD2Q15784 382 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 FLT4P35916 1363 aa21.49■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.49■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 AMPHP49418 695 aa21.48■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 PRKAR2BP31323 418 aa21.48■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms