RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 SSH2Q76I76 1423 aa21.8■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 C14orf37Q86TY3 774 aa21.79■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 COG3Q96JB2 828 aa21.79■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.79■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.77■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.77■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.76■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 SHPRHQ149N8 1683 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 STRCQ7RTU9 1775 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.75■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 POLKQ9UBT6 870 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.72■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 FBLN1P23142 703 aa21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 PDE3BQ13370 1112 aa21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 NUDCQ9Y266 331 aa21.71■■□□□ 1.07
USP20-204ENST00000472108 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 TMEM94Q12767 1356 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.69■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 USP31Q70CQ4 1352 aa21.68■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 APAF1O14727 1248 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 NGEFQ8N5V2 710 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 RUNDC1Q96C34 613 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 DCCP43146 1447 aa21.65■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 ORAI2Q96SN7 254 aa21.64■■□□□ 1.06
USP20-204ENST00000472108 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ATF3P18847 181 aa21.64■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PSME1Q06323 249 aa21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ZNF521Q96K83 1311 aa21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.63■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PIK3C2AO00443 1686 aa21.62■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 NLRP6P59044 892 aa21.62■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ABTB2Q8N961 1025 aa21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.6■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 MST1RQ04912 1400 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 IL13P35225 146 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 MSH6P52701 1360 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 FOXO3O43524 673 aa21.58■■□□□ 1.05
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USP20-204ENST00000472108 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
USP20-204ENST00000472108 USP54Q70EL1 1684 aa21.57■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 FCHSD2O94868 740 aa21.57■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.57■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 NEFLP07196 543 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 GOLGA2Q08379 1002 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 KIF1AQ12756 1690 aa21.56■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.55■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.54■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 SOX12O15370 315 aa21.53■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 CCDC27Q2M243 656 aa21.53■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 WWC1Q8IX03 1113 aa21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 FKBP8Q14318 412 aa21.52■■□□□ 1.04
USP20-204ENST00000472108 SBNO1A3KN83 1393 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 SLFN5Q08AF3 891 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 PEAK1Q9H792 1746 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 NEUROD2Q15784 382 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 FLT4P35916 1363 aa21.49■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.49■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 AMPHP49418 695 aa21.48■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 PRKAR2BP31323 418 aa21.48■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP20-204ENST00000472108 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.47■■□□□ 1.03
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