RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466252.5

SNX21-208, Transcript of sorting nexin family member 21, human

TSL 3

Gene SNX21, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX21-208	ENST00000466252	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	AKAP12	Q02952	1782 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
SNX21-208	ENST00000466252	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252		A0A1W2PP64	1363 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	NLRP13	Q86W25	1043 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SNX21-208	ENST00000466252	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	NLRP6	P59044	892 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	USP19	O94966	1318 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	AFF2	P51816	1311 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.02	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
SNX21-208	ENST00000466252	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	GC	P02774	474 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	MYOM1	P52179	1685 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	NME9	Q86XW9	330 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SNX21-208	ENST00000466252	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	USP21	Q9UK80	565 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	SLIT2	O94813	1529 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	SLIT3	O75094	1523 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	FYB1	O15117	783 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	CPD	O75976	1380 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SNX21-208	ENST00000466252	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	PANK3	Q9H999	370 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.82	■■■□□ 2.69
SNX21-208	ENST00000466252	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	ATRN	O75882	1429 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	RXRB	P28702	533 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	COG3	Q96JB2	828 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	NFAT5	O94916	1531 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	SOX12	O15370	315 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	VPS72	Q15906	364 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	COL18A1	P39060	1754 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SNX21-208	ENST00000466252	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	NRAP	Q86VF7	1730 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	FBLN1	P23142	703 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SNX21-208	ENST00000466252	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	EVA1C	P58658	441 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	STRN4	Q9NRL3	753 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66

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