RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IL6-208	ENST00000464710	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.46	□□□□□ -0.57
IL6-208	ENST00000464710		A0A1W2PP64	1363 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	SOX12	O15370	315 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	NME9	Q86XW9	330 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	USP6	P35125	1406 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	PHLPP1	O60346	1717 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	COG3	Q96JB2	828 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	FYB1	O15117	783 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	PXDN	Q92626	1479 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	ITSN1	Q15811	1721 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	GC	P02774	474 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IL6-208	ENST00000464710	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.4	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		11.39	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	SSH2	Q76I76	1423 aa		11.39	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.39	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	FBLN1	P23142	703 aa		11.38	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.38	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.37	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.36	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	EVA1C	P58658	441 aa		11.36	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.36	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.36	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	AMPH	P49418	695 aa		11.35	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	AKAP12	Q02952	1782 aa		11.35	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	USP19	O94966	1318 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IL6-208	ENST00000464710	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	STRN4	Q9NRL3	753 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	MYOM1	P52179	1685 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	USP21	Q9UK80	565 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	NSD2	O96028	1365 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	AFF2	P51816	1311 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	ANP32C	O43423	234 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	POLK	Q9UBT6	870 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	MTHFS	P49914	203 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	IP6K1	Q92551	441 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	PIK3C2A	O00443	1686 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	HOXC9	P31274	260 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	RALBP1	Q15311	655 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	LRP6	O75581	1613 aa		11.27	□□□□□ -0.6
IL6-208	ENST00000464710	PPP2R1A	P30153	589 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IL6-208	ENST00000464710	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IL6-208	ENST00000464710	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IL6-208	ENST00000464710	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IL6-208	ENST00000464710	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IL6-208	ENST00000464710	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
IL6-208	ENST00000464710	CPD	O75976	1380 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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