RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448576.6

GATAD2A-209, Transcript of GATA zinc finger domain containing 2A, human

TSL 3

Gene GATAD2A, Length 271 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GATAD2A-209	ENST00000448576	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		41.08	■■■■■ 4.17
GATAD2A-209	ENST00000448576	FAM83G	A6ND36	823 aa		41.06	■■■■■ 4.16
GATAD2A-209	ENST00000448576	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		41.06	■■■■■ 4.16
GATAD2A-209	ENST00000448576	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	41.05	■■■■■ 4.16
GATAD2A-209	ENST00000448576	VPS72	Q15906	364 aa		41.05	■■■■■ 4.16
GATAD2A-209	ENST00000448576	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	41.04	■■■■■ 4.16
GATAD2A-209	ENST00000448576	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	41	■■■■■ 4.15
GATAD2A-209	ENST00000448576	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	41	■■■■■ 4.15
GATAD2A-209	ENST00000448576	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		40.98	■■■■■ 4.15
GATAD2A-209	ENST00000448576	ACE	P12821	1306 aa		40.96	■■■■■ 4.15
GATAD2A-209	ENST00000448576	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		40.95	■■■■■ 4.15
GATAD2A-209	ENST00000448576	BTG4	Q9NY30	223 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GATAD2A-209	ENST00000448576	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GATAD2A-209	ENST00000448576	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
GATAD2A-209	ENST00000448576	NEUROD1	Q13562	356 aa		40.9	■■■■■ 4.14
GATAD2A-209	ENST00000448576	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		40.9	■■■■■ 4.14
GATAD2A-209	ENST00000448576	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	40.9	■■■■■ 4.14
GATAD2A-209	ENST00000448576	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		40.9	■■■■■ 4.14
GATAD2A-209	ENST00000448576	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GATAD2A-209	ENST00000448576	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
GATAD2A-209	ENST00000448576	CABP2	Q9NPB3	220 aa		40.86	■■■■■ 4.13
GATAD2A-209	ENST00000448576	KIAA0232	Q92628	1395 aa		40.85	■■■■■ 4.13
GATAD2A-209	ENST00000448576	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GATAD2A-209	ENST00000448576	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		40.83	■■■■■ 4.13
GATAD2A-209	ENST00000448576	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	CCDC125	Q86Z20	511 aa		40.81	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		40.79	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	USP19	O94966	1318 aa		40.76	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
GATAD2A-209	ENST00000448576	CHRNA2	Q15822	529 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	ABTB2	Q8N961	1025 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	USP6	P35125	1406 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	40.71	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	CABP1	Q9NZU7	370 aa		40.7	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	EVC2	Q86UK5	1308 aa		40.69	■■■■■ 4.11
GATAD2A-209	ENST00000448576	AKAP12	Q02952	1782 aa		40.69	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576		A0A0G2JS52	829 aa		40.68	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	MYT1	Q01538	1121 aa		40.68	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	CPD	O75976	1380 aa		40.68	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	PIK3C2A	O00443	1686 aa		40.68	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	SSH2	Q76I76	1423 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		40.65	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	SLIT3	O75094	1523 aa		40.63	■■■■■ 4.1
GATAD2A-209	ENST00000448576	NLRP13	Q86W25	1043 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GATAD2A-209	ENST00000448576	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		40.61	■■■■■ 4.09
GATAD2A-209	ENST00000448576	STRN4	Q9NRL3	753 aa		40.61	■■■■■ 4.09
GATAD2A-209	ENST00000448576	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		40.6	■■■■■ 4.09
GATAD2A-209	ENST00000448576	GC	P02774	474 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GATAD2A-209	ENST00000448576	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GATAD2A-209	ENST00000448576	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		40.57	■■■■■ 4.09
GATAD2A-209	ENST00000448576	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	TONSL	Q96HA7	1378 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		40.53	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	40.52	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	FAM182B	Q5T319	152 aa		40.52	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	COL18A1	P39060	1754 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	NLRP6	P59044	892 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GATAD2A-209	ENST00000448576	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		40.5	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	USP35	Q9P2H5	1018 aa		40.47	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	EVA1C	P58658	441 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GATAD2A-209	ENST00000448576	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		40.42	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		40.4	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	RGPD5	Q99666	1765 aa		40.4	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	USP54	Q70EL1	1684 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.06
GATAD2A-209	ENST00000448576	BAG6	P46379	1132 aa		40.38	■■■■■ 4.05
GATAD2A-209	ENST00000448576	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.38	■■■■■ 4.05
GATAD2A-209	ENST00000448576	NFAT5	O94916	1531 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GATAD2A-209	ENST00000448576	CRB1	P82279	1406 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GATAD2A-209	ENST00000448576	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GATAD2A-209	ENST00000448576	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		40.35	■■■■■ 4.05
GATAD2A-209	ENST00000448576	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
GATAD2A-209	ENST00000448576	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GATAD2A-209	ENST00000448576	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GATAD2A-209	ENST00000448576	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
GATAD2A-209	ENST00000448576	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		40.29	■■■■■ 4.04
GATAD2A-209	ENST00000448576	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		40.29	■■■■■ 4.04
GATAD2A-209	ENST00000448576	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		40.26	■■■■■ 4.04
GATAD2A-209	ENST00000448576	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GATAD2A-209	ENST00000448576	USP31	Q70CQ4	1352 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GATAD2A-209	ENST00000448576	TRIM37	O94972	964 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GATAD2A-209	ENST00000448576	PDE3B	Q13370	1112 aa		40.24	■■■■■ 4.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms