RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DEPDC5O75140 1603 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPRJ-202ENST00000440289 LAMC1P11047 1609 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRJ-202ENST00000440289 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.72■■□□□ 1.23
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PTPRJ-202ENST00000440289 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.64■■□□□ 1.21
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PTPRJ-202ENST00000440289 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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