RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FSD2A1L4K1 749 aa10.76□□□□□ -0.69
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RABGEF1-203ENST00000439720 SEC24BO95487 1268 aa10.71□□□□□ -0.7
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
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RABGEF1-203ENST00000439720 CNPY4Q8N129 248 aa10.69□□□□□ -0.7
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RABGEF1-203ENST00000439720 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
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RABGEF1-203ENST00000439720 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-203ENST00000439720 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.67□□□□□ -0.7
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RABGEF1-203ENST00000439720 CERS3Q8IU89 383 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-203ENST00000439720 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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RABGEF1-203ENST00000439720 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.65□□□□□ -0.71
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RABGEF1-203ENST00000439720 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.64□□□□□ -0.71
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RABGEF1-203ENST00000439720 MLECQ14165 292 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-203ENST00000439720 PTCH1Q13635 1447 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRB2O60241 1585 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-203ENST00000439720 TECPR2O15040 1411 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-203ENST00000439720 MTMR7Q9Y216 660 aa10.61□□□□□ -0.71
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RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 MSNP26038 577 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
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