RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C8orf37Q96NL8 207 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EID1Q9Y6B2 187 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRB3O60242 1522 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDE4AP27815 886 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POTEFA5A3E0 1075 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFSD10Q14728 455 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEMA3EO15041 775 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRINP3Q76B58 766 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MICALL2Q8IY33 904 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP162Q5TB80 1403 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATRNO75882 1429 aa8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFYVE9O95405 1425 aa8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAMTS2O95450 1211 aa8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MST1RQ04912 1400 aa8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.79□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POTEJP0CG39 1038 aa8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IDI1Q13907 227 aa8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NGLY1Q96IV0 654 aa8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GLI3P10071 1580 aa8.78□□□□□ -1
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATF3P18847 181 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAMK2BQ13554 666 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRPM2O94759 1503 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LAMC1P11047 1609 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP21Q9UK80 565 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNC13BO14795 1591 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMC2Q8TDI7 906 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOS1P29475 1434 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRUQ92729 1446 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCCP43146 1447 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HRCP23327 699 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPY4P0CV99 314 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPY10P0CW01 314 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YY1P25490 414 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFFO2Q5TF58 517 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC125Q86Z20 511 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERBINQ96RT1 1412 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTCH1Q13635 1447 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF15Q9NS87 1388 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYOM2P54296 1465 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZMYND10O75800 440 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBX22Q9Y458 520 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms