RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434561.1

TP53BP1-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM182B	Q5T319	152 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TP53BP1-208	ENST00000434561	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	BTG4	Q9NY30	223 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP7B	P35670	1465 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TP53BP1-208	ENST00000434561	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIAA0232	Q92628	1395 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	USP35	Q9P2H5	1018 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ACE	P12821	1306 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	BAG6	P46379	1132 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRP5	O75197	1615 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRIM37	O94972	964 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	EVA1C	P58658	441 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	RREB1	Q92766	1687 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	COL18A1	P39060	1754 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	APBA3	O96018	575 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	USP19	O94966	1318 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	SOX12	O15370	315 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	GC	P02774	474 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	PEAK1	Q9H792	1746 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	NLRP6	P59044	892 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	LTN1	O94822	1766 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TP53BP1-208	ENST00000434561	USP6	P35125	1406 aa		13.21	□□□□□ -0.3
TP53BP1-208	ENST00000434561	CPD	O75976	1380 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLIT3	O75094	1523 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TP53BP1-208	ENST00000434561	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TP53BP1-208	ENST00000434561	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TP53BP1-208	ENST00000434561	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TP53BP1-208	ENST00000434561	CRB1	P82279	1406 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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