RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 NEUROD1Q13562 356 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 BTG4Q9NY30 223 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 ACEP12821 1306 aa21.77■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 A0A0G2JS52 829 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 MYT1Q01538 1121 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 CABP2Q9NPB3 220 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC3-206ENST00000431413 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 ABTB2Q8N961 1025 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.69■■□□□ 1.06
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HERC3-206ENST00000431413 EVC2Q86UK5 1308 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 KIAA0232Q92628 1395 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 NLRP13Q86W25 1043 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.66■■□□□ 1.06
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HERC3-206ENST00000431413 CABP1Q9NZU7 370 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 NRAPQ86VF7 1730 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC3-206ENST00000431413 EP400Q96L91 3159 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 CHRNA2Q15822 529 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 STRN4Q9NRL3 753 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 EVA1CP58658 441 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 USP19O94966 1318 aa21.6■■□□□ 1.05
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HERC3-206ENST00000431413 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 GCP02774 474 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 CPDO75976 1380 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 USP6P35125 1406 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 NLRP6P59044 892 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HERC3-206ENST00000431413 TONSLQ96HA7 1378 aa21.58■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 BAG6P46379 1132 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 USP35Q9P2H5 1018 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 SSH2Q76I76 1423 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-206ENST00000431413 BARGINQ6ZT62 677 aa21.52■■□□□ 1.04
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HERC3-206ENST00000431413 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 PDE3BQ13370 1112 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 FAM182BQ5T319 152 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-206ENST00000431413 SLIT3O75094 1523 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 CRB1P82279 1406 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 SLC24A1O60721 1099 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 TMC1Q8TDI8 760 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 PIK3C2AO00443 1686 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 TRIM37O94972 964 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 SOX12O15370 315 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 DISP2A7MBM2 1401 aa21.39■■□□□ 1.02
HERC3-206ENST00000431413 AKAP12Q02952 1782 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 APBA3O96018 575 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.37■■□□□ 1.01
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