RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

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Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 A0A0G2JS52 829 aa27■■□□□ 1.91
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYT1Q01538 1121 aa27■■□□□ 1.91
LIN28AP1-201ENST00000429574 ALS2Q96Q42 1657 aa27■■□□□ 1.91
LIN28AP1-201ENST00000429574 ACEP12821 1306 aa26.99■■□□□ 1.91
LIN28AP1-201ENST00000429574 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.98■■□□□ 1.91
LIN28AP1-201ENST00000429574 BTG4Q9NY30 223 aa26.98■■□□□ 1.91
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.97■■□□□ 1.91
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC125Q86Z20 511 aa26.96■■□□□ 1.91
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LIN28AP1-201ENST00000429574 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.95■■□□□ 1.9
LIN28AP1-201ENST00000429574 GLI3P10071 1580 aa26.94■■□□□ 1.9
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ABTB2Q8N961 1025 aa26.94■■□□□ 1.9
LIN28AP1-201ENST00000429574 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.91■■□□□ 1.9
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LIN28AP1-201ENST00000429574 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.86■■□□□ 1.89
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LIN28AP1-201ENST00000429574 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.86■■□□□ 1.89
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIAA0232Q92628 1395 aa26.85■■□□□ 1.89
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LIN28AP1-201ENST00000429574 NRAPQ86VF7 1730 aa26.84■■□□□ 1.89
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.8■■□□□ 1.88
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.8■■□□□ 1.88
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.8■■□□□ 1.88
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.77■■□□□ 1.88
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LIN28AP1-201ENST00000429574 USP35Q9P2H5 1018 aa26.75■■□□□ 1.87
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LIN28AP1-201ENST00000429574 EP400Q96L91 3159 aa26.73■■□□□ 1.87
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.72■■□□□ 1.87
LIN28AP1-201ENST00000429574 USP19O94966 1318 aa26.71■■□□□ 1.87
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LIN28AP1-201ENST00000429574 CPDO75976 1380 aa26.71■■□□□ 1.87
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SSH2Q76I76 1423 aa26.66■■□□□ 1.86
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDE3BQ13370 1112 aa26.66■■□□□ 1.86
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.65■■□□□ 1.86
LIN28AP1-201ENST00000429574 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.65■■□□□ 1.86
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM182BQ5T319 152 aa26.64■■□□□ 1.86
LIN28AP1-201ENST00000429574 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.64■■□□□ 1.86
LIN28AP1-201ENST00000429574 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.64■■□□□ 1.86
LIN28AP1-201ENST00000429574 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.63■■□□□ 1.85
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SOX12O15370 315 aa26.62■■□□□ 1.85
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LIN28AP1-201ENST00000429574 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC24A1O60721 1099 aa26.59■■□□□ 1.85
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LIN28AP1-201ENST00000429574 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.58■■□□□ 1.85
LIN28AP1-201ENST00000429574 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.58■■□□□ 1.85
LIN28AP1-201ENST00000429574 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SLIT3O75094 1523 aa26.57■■□□□ 1.84
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LIN28AP1-201ENST00000429574 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
LIN28AP1-201ENST00000429574 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.55■■□□□ 1.84
LIN28AP1-201ENST00000429574 CRB1P82279 1406 aa26.55■■□□□ 1.84
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LIN28AP1-201ENST00000429574 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.52■■□□□ 1.84
LIN28AP1-201ENST00000429574 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.51■■□□□ 1.83
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.51■■□□□ 1.83
LIN28AP1-201ENST00000429574 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
LIN28AP1-201ENST00000429574 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.51■■□□□ 1.83
LIN28AP1-201ENST00000429574 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
LIN28AP1-201ENST00000429574 APBA3O96018 575 aa26.49■■□□□ 1.83
LIN28AP1-201ENST00000429574 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.48■■□□□ 1.83
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