RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 PTPRMP28827 1452 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 KIF16BQ96L93 1317 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.39■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.39■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
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HCLS1-202ENST00000428394 RLBP1P12271 317 aa21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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HCLS1-202ENST00000428394 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 IL27Q8NEV9 243 aa21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PP64 1363 aa21.38■■□□□ 1.01
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HCLS1-202ENST00000428394 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.37■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.36■■□□□ 1.01
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HCLS1-202ENST00000428394 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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HCLS1-202ENST00000428394 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.34■■□□□ 1.01
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HCLS1-202ENST00000428394 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.33■■□□□ 1.01
HCLS1-202ENST00000428394 ATP7BP35670 1465 aa21.33■■□□□ 1
HCLS1-202ENST00000428394 SEC24BO95487 1268 aa21.32■■□□□ 1
HCLS1-202ENST00000428394 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.32■■□□□ 1
HCLS1-202ENST00000428394 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.32■■□□□ 1
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HCLS1-202ENST00000428394 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.31■■□□□ 1
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HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.29■■□□□ 1
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.29■■□□□ 1
HCLS1-202ENST00000428394 FCHSD2O94868 740 aa21.28■■□□□ 1
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HCLS1-202ENST00000428394 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.27■□□□□ 0.99
HCLS1-202ENST00000428394 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.27■□□□□ 0.99
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HCLS1-202ENST00000428394 SNX21Q969T3 373 aa21.23■□□□□ 0.99
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HCLS1-202ENST00000428394 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.15■□□□□ 0.98
HCLS1-202ENST00000428394 PRAM1Q96QH2 718 aa21.14■□□□□ 0.98
HCLS1-202ENST00000428394 IFT57Q9NWB7 429 aa21.14■□□□□ 0.98
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.14■□□□□ 0.97
HCLS1-202ENST00000428394 GNAI1P63096 354 aa21.14■□□□□ 0.97
HCLS1-202ENST00000428394 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HCLS1-202ENST00000428394 NFE2L2Q16236 605 aa21.13■□□□□ 0.97
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