RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.29□□□□□ -0.28
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NME9Q86XW9 330 aa13.08□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFAP53Q96M91 514 aa13.08□□□□□ -0.32
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABTB2Q8N961 1025 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUDCQ9Y266 331 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIK3C2AO00443 1686 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRINP3Q76B58 766 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SBNO1A3KN83 1393 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AATKQ6ZMQ8 1374 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOM1O60784 492 aa13.04□□□□□ -0.32
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