RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 USP47Q96K76 1375 aa35.23■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 TESK2Q96S53 571 aa35.22■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 SOCS7O14512 581 aa35.21■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.21■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ABTB2Q8N961 1025 aa35.18■■■■□ 3.22
HTATSF1-202ENST00000425695 RXRBP28702 533 aa35.17■■■■□ 3.22
HTATSF1-202ENST00000425695 TMC1Q8TDI8 760 aa35.17■■■■□ 3.22
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCA3Q99758 1704 aa35.17■■■■□ 3.22
HTATSF1-202ENST00000425695 USP6P35125 1406 aa35.14■■■■□ 3.22
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM83GA6ND36 823 aa35.1■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.1■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.09■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC24A1O60721 1099 aa35.09■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TMF1P82094 1093 aa35.07■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.06■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 AKAP12Q02952 1782 aa35.06■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 NLRP13Q86W25 1043 aa35.06■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.06■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 SLIT2O94813 1529 aa35.06■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.05■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 NLRP6P59044 892 aa35.04■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 SSH2Q76I76 1423 aa35.04■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 ATRNO75882 1429 aa35.03■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.02■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.99■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 CHRNA2Q15822 529 aa34.99■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.99■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 BTG4Q9NY30 223 aa34.99■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0232Q92628 1395 aa34.99■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.98■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.98■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 USP19O94966 1318 aa34.98■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 GCP02774 474 aa34.96■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.95■■■■□ 3.19
HTATSF1-202ENST00000425695 PIK3C2AO00443 1686 aa34.95■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.94■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.93■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PP64 1363 aa34.92■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 CDCA8Q53HL2 280 aa34.92■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.91■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.91■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.91■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 RGS12O14924 1447 aa34.9■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS72Q15906 364 aa34.9■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.89■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 NME9Q86XW9 330 aa34.89■■■■□ 3.18
HTATSF1-202ENST00000425695 SOX12O15370 315 aa34.88■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.86■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 NRAPQ86VF7 1730 aa34.85■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 STRN4Q9NRL3 753 aa34.84■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 CPDO75976 1380 aa34.84■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 GLI3P10071 1580 aa34.83■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 SLIT3O75094 1523 aa34.83■■■■□ 3.17
HTATSF1-202ENST00000425695 EVA1CP58658 441 aa34.81■■■■□ 3.16
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.8■■■■□ 3.16
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.8■■■■□ 3.16
HTATSF1-202ENST00000425695 USP31Q70CQ4 1352 aa34.78■■■■□ 3.16
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.76■■■■□ 3.16
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.74■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.74■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.73■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.73■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0G2JS52 829 aa34.72■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 MYT1Q01538 1121 aa34.72■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.71■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.71■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 USP35Q9P2H5 1018 aa34.7■■■■□ 3.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 MYOM1P52179 1685 aa34.69■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NFAT5O94916 1531 aa34.68■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.68■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.67■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 COG3Q96JB2 828 aa34.67■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.66■■■■□ 3.14
HTATSF1-202ENST00000425695 USP54Q70EL1 1684 aa34.66■■■■□ 3.14
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