RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423183.1

ACTG1P12-201, Transcript of actin gamma 1 pseudogene 12, humanhuman

BASIC

Gene ACTG1P12, Length 1,166 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P12-201ENST00000423183 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 ACEP12821 1306 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 CFAP53Q96M91 514 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 HSPA2P54652 639 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 USP31Q70CQ4 1352 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 TMEM94Q12767 1356 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
ACTG1P12-201ENST00000423183 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 COG3Q96JB2 828 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 MTHFSP49914 203 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 MST1RQ04912 1400 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 C14orf37Q86TY3 774 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 NME9Q86XW9 330 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 NUTM2FA1L443 756 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 MSH6P52701 1360 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 NGEFQ8N5V2 710 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTG1P12-201ENST00000423183 PEAK1Q9H792 1746 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 ALS2Q96Q42 1657 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 PDE3BQ13370 1112 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 SLIT3O75094 1523 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 NUDCQ9Y266 331 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 LTN1O94822 1766 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 ATF3P18847 181 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 POLKQ9UBT6 870 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 NFAT5O94916 1531 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 RTL1A6NKG5 1358 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 SBNO1A3KN83 1393 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTG1P12-201ENST00000423183 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 RUNDC1Q96C34 613 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 FLT4P35916 1363 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 ZNF521Q96K83 1311 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 PXDNQ92626 1479 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 ABCC6O95255 1503 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 PSME1Q06323 249 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 ABTB2Q8N961 1025 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 ORAI2Q96SN7 254 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 TNS3Q68CZ2 1445 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 USP19O94966 1318 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 NLRP6P59044 892 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P12-201ENST00000423183 ARHGEF10O15013 1369 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 APAF1O14727 1248 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 IL13P35225 146 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 CCDC27Q2M243 656 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 FCHSD2O94868 740 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 NEFLP07196 543 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 ABCA3Q99758 1704 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 FOXO3O43524 673 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 FBLN1P23142 703 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 GOLGA2Q08379 1002 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P12-201ENST00000423183 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms