RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 BAP1Q92560 729 aa8.41□□□□□ -1.06
TRDN-203ENST00000422596 ALDH1A1P00352 501 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-203ENST00000422596 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-203ENST00000422596 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-203ENST00000422596 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-203ENST00000422596 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-203ENST00000422596 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 GOPCQ9HD26 462 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 QPCTQ16769 361 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 LYPD8Q6UX82 237 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 CTHP32929 405 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 ZNF511Q8NB15 262 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 MAP10Q9P2G4 905 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 TSC1Q92574 1164 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-203ENST00000422596 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 LILRB3O75022 631 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 FOXJ1Q92949 421 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 BMP1P13497 986 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 TREML4Q6UXN2 200 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 TRIM47Q96LD4 638 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRDN-203ENST00000422596 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 SENP2Q9HC62 589 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 NNTQ13423 1086 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 MPNDQ8N594 471 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 ARID5BQ14865 1188 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 AGERQ15109 404 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 WFS1O76024 890 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 ADH1CP00326 375 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 LCE2CQ5TA81 110 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 KIFC2Q96AC6 838 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 CDK15Q96Q40 435 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 TIMP2P16035 220 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TRDN-203ENST00000422596 NR3C2P08235 984 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 GRM5P41594 1212 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.2□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.2□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.2□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 ZFP42Q96MM3 310 aa8.2□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.19□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 NBPF14Q5TI25 921 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 ITPKCQ96DU7 683 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.17□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.17□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 RFC5P40937 340 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 NR5A1Q13285 461 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 NR6A1Q15406 480 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 FSHRP23945 695 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 VEGFBP49765 207 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDN-203ENST00000422596 SOBPA7XYQ1 873 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 AP1G2O75843 785 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 BANK1Q8NDB2 785 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 ERFEQ4G0M1 354 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-203ENST00000422596 WIPF1O43516 503 aa8.12□□□□□ -1.11
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