RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 CERKQ8TCT0 537 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 NRKQ7Z2Y5 1582 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 FOXO3O43524 673 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.52□□□□□ -0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 TOM1O60784 492 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 PSME1Q06323 249 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 NSD2O96028 1365 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 FYB1O15117 783 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 PXDNQ92626 1479 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 ANP32CO43423 234 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 NME9Q86XW9 330 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 SBNO1A3KN83 1393 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 PIK3C2AO00443 1686 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 RALBP1Q15311 655 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 USP31Q70CQ4 1352 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 DSG3P32926 999 aa13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.46□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.46□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 USP54Q70EL1 1684 aa13.46□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 MIER1Q8N108 512 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 ALS2Q96Q42 1657 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.44□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 ABTB2Q8N961 1025 aa13.44□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 PIP4K2BP78356 416 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 MORC1Q86VD1 984 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 COG3Q96JB2 828 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 NLRP6P59044 892 aa13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 ARHGEF10O15013 1369 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 NLRP13Q86W25 1043 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 AATKQ6ZMQ8 1374 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 USP19O94966 1318 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 PPP2R1AP30153 589 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLIT3O75094 1523 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 PHLPP1O60346 1717 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCER2I3L3R5 266 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 FBXO41Q8TF61 875 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.37□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 FBLN1P23142 703 aa13.36□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 NFAT5O94916 1531 aa13.36□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.36□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 POLKQ9UBT6 870 aa13.36□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 GCP02774 474 aa13.35□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 MTHFSP49914 203 aa13.35□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC184Q52MB2 194 aa13.35□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 PNPLA6Q8IY17 1366 aa13.35□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 SOX12O15370 315 aa13.33□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.33□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.33□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.33□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 INSRP06213 1382 aa13.32□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 ABCA3Q99758 1704 aa13.32□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.31□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 CAPN15O75808 1086 aa13.31□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.31□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 MRS2Q9HD23 443 aa13.31□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 PEAK1Q9H792 1746 aa13.31□□□□□ -0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 CPDO75976 1380 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms