RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 NGLY1Q96IV0 654 aa25.31■■□□□ 1.64
SEMA3B-201ENST00000416295 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SEMA3B-201ENST00000416295 ALS2Q96Q42 1657 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-201ENST00000416295 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-201ENST00000416295 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SEMA3B-201ENST00000416295 TMF1P82094 1093 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 USP6P35125 1406 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 USP21Q9UK80 565 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCA3Q99758 1704 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 PLEKHG5O94827 1062 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 CDCA8Q53HL2 280 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 ABTB2Q8N961 1025 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 TMC1Q8TDI8 760 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-201ENST00000416295 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 SSH2Q76I76 1423 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 AKAP12Q02952 1782 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 RGS12O14924 1447 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 NLRP13Q86W25 1043 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 ATRNO75882 1429 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-201ENST00000416295 USP19O94966 1318 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 SLIT2O94813 1529 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 A0A1W2PP64 1363 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 NLRP6P59044 892 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 PIK3C2AO00443 1686 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.08■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.08■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM83GA6ND36 823 aa25.07■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.07■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 KIAA0232Q92628 1395 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 GCP02774 474 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 SLIT3O75094 1523 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 CPDO75976 1380 aa25.04■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SEMA3B-201ENST00000416295 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.01■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 BTG4Q9NY30 223 aa25.01■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 USP31Q70CQ4 1352 aa25.01■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 NME9Q86XW9 330 aa25■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 MYOM1P52179 1685 aa25■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 CHRNA2Q15822 529 aa24.98■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 VPS72Q15906 364 aa24.98■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.98■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 USP54Q70EL1 1684 aa24.97■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 NRAPQ86VF7 1730 aa24.97■■□□□ 1.59
SEMA3B-201ENST00000416295 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 GLI3P10071 1580 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 NFAT5O94916 1531 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 SOX12O15370 315 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 COG3Q96JB2 828 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 EVA1CP58658 441 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC125Q86Z20 511 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 STRN4Q9NRL3 753 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 FYB1O15117 783 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCC6O95255 1503 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-201ENST00000416295 EP400Q96L91 3159 aa24.84■■□□□ 1.57
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