RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407308.1

DUSP18-206, Transcript of dual specificity phosphatase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene DUSP18, Length 1,978 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18-206ENST00000407308 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
DUSP18-206ENST00000407308 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.29■■□□□ 1.16
DUSP18-206ENST00000407308 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.28■■□□□ 1.16
DUSP18-206ENST00000407308 SHPRHQ149N8 1683 aa22.28■■□□□ 1.16
DUSP18-206ENST00000407308 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
DUSP18-206ENST00000407308 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.27■■□□□ 1.16
DUSP18-206ENST00000407308 NUTM2FA1L443 756 aa22.27■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 MORC1Q86VD1 984 aa22.27■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 CABP1Q9NZU7 370 aa22.27■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.27■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.25■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.24■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.23■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 ITSN1Q15811 1721 aa22.23■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
DUSP18-206ENST00000407308 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 PXDNQ92626 1479 aa22.2■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 FOXO3O43524 673 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.19■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.18■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.17■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 PSME1Q06323 249 aa22.16■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.15■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 FYB1O15117 783 aa22.15■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.15■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 CFAP53Q96M91 514 aa22.14■■□□□ 1.14
DUSP18-206ENST00000407308 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.14■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 AKAP12Q02952 1782 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 SBNO1A3KN83 1393 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.12■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.1■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 LRP6O75581 1613 aa22.09■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.09■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.09■■□□□ 1.13
DUSP18-206ENST00000407308 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 MTHFSP49914 203 aa22.07■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 ARHGEF10O15013 1369 aa22.07■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 PDE3BQ13370 1112 aa22.06■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 NGEFQ8N5V2 710 aa22.06■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 ACEP12821 1306 aa22.05■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 USP6P35125 1406 aa22.04■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.03■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
DUSP18-206ENST00000407308 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.02■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 COG3Q96JB2 828 aa22.01■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.01■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 ALS2Q96Q42 1657 aa22.01■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 NUDCQ9Y266 331 aa21.99■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 SSH2Q76I76 1423 aa21.98■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.98■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 NEFLP07196 543 aa21.98■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 NME9Q86XW9 330 aa21.98■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 ADAMTS2O95450 1211 aa21.96■■□□□ 1.11
DUSP18-206ENST00000407308 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 C8orf37Q96NL8 207 aa21.95■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 ABCA3Q99758 1704 aa21.94■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 AFF2P51816 1311 aa21.93■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.93■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.93■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 NGLY1Q96IV0 654 aa21.93■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 POLKQ9UBT6 870 aa21.92■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 RUNDC1Q96C34 613 aa21.92■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 ILDR2Q71H61 639 aa21.91■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 USP31Q70CQ4 1352 aa21.91■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
DUSP18-206ENST00000407308 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.89■■□□□ 1.09
DUSP18-206ENST00000407308 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
DUSP18-206ENST00000407308 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms