RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404287.2

MESTP1-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 1, humanhuman

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Gene MESTP1, Length 994 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP1-201ENST00000404287 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.18■■□□□ 1.94
MESTP1-201ENST00000404287 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.17■■□□□ 1.94
MESTP1-201ENST00000404287 C8orf37Q96NL8 207 aa27.17■■□□□ 1.94
MESTP1-201ENST00000404287 AFF2P51816 1311 aa27.16■■□□□ 1.94
MESTP1-201ENST00000404287 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
MESTP1-201ENST00000404287 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
MESTP1-201ENST00000404287 AKAP12Q02952 1782 aa27.14■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.11■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.11■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 SLC24A1O60721 1099 aa27.1■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 PLEKHG5O94827 1062 aa27.1■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 NGLY1Q96IV0 654 aa27.1■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.09■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.08■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 SLIT2O94813 1529 aa27.08■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 TMF1P82094 1093 aa27.08■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
MESTP1-201ENST00000404287 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.07■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 USP19O94966 1318 aa27.07■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 PIK3C2AO00443 1686 aa27.06■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 ABTB2Q8N961 1025 aa27.06■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.06■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 TMC1Q8TDI8 760 aa27.05■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 A0A1W2PP64 1363 aa27.04■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.03■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 FAM83GA6ND36 823 aa27.02■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 USP21Q9UK80 565 aa27.02■■□□□ 1.92
MESTP1-201ENST00000404287 ATRNO75882 1429 aa27.01■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 SLIT3O75094 1523 aa27■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.99■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.99■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 NLRP13Q86W25 1043 aa26.98■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 MYOM1P52179 1685 aa26.98■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 KIAA0232Q92628 1395 aa26.97■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 NLRP6P59044 892 aa26.96■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.96■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.96■■□□□ 1.91
MESTP1-201ENST00000404287 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 GCP02774 474 aa26.95■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 CDCA8Q53HL2 280 aa26.95■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.95■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.95■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.95■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 NRAPQ86VF7 1730 aa26.94■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 CPDO75976 1380 aa26.94■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 USP31Q70CQ4 1352 aa26.94■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 USP54Q70EL1 1684 aa26.93■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 RXRBP28702 533 aa26.93■■□□□ 1.9
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MESTP1-201ENST00000404287 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 NME9Q86XW9 330 aa26.92■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.91■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 CHRNA2Q15822 529 aa26.9■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 BTG4Q9NY30 223 aa26.9■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.89■■□□□ 1.9
MESTP1-201ENST00000404287 GLI3P10071 1580 aa26.88■■□□□ 1.89
MESTP1-201ENST00000404287 NFAT5O94916 1531 aa26.88■■□□□ 1.89
MESTP1-201ENST00000404287 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.88■■□□□ 1.89
MESTP1-201ENST00000404287 RGS12O14924 1447 aa26.88■■□□□ 1.89
MESTP1-201ENST00000404287 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.88■■□□□ 1.89
MESTP1-201ENST00000404287 VPS72Q15906 364 aa26.86■■□□□ 1.89
MESTP1-201ENST00000404287 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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MESTP1-201ENST00000404287 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.85■■□□□ 1.89
MESTP1-201ENST00000404287 COL18A1P39060 1754 aa26.82■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.82■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.81■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.8■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 FYB1O15117 783 aa26.78■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.77■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.77■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 SOX12O15370 315 aa26.77■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.77■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.77■■□□□ 1.88
MESTP1-201ENST00000404287 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.76■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.76■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.73■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.72■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 STRN4Q9NRL3 753 aa26.72■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.71■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 ABCC6O95255 1503 aa26.71■■□□□ 1.87
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