RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
GGTA1P-201ENST00000373793 SSH2Q76I76 1423 aa36.42■■■■□ 3.42
GGTA1P-201ENST00000373793 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
GGTA1P-201ENST00000373793 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
GGTA1P-201ENST00000373793 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.4■■■■□ 3.42
GGTA1P-201ENST00000373793 KNSTRNQ9Y448 316 aa36.39■■■■□ 3.42
GGTA1P-201ENST00000373793 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 SBNO1A3KN83 1393 aa36.37■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.35■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.33■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.33■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.33■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.32■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.32■■■■□ 3.41
GGTA1P-201ENST00000373793 ALS2Q96Q42 1657 aa36.32■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 FBXO41Q8TF61 875 aa36.32■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 NME9Q86XW9 330 aa36.31■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ABTB2Q8N961 1025 aa36.31■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 PIK3C2AO00443 1686 aa36.31■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 FYB1O15117 783 aa36.28■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 HSPA1LP34931 641 aa36.28■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.27■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
GGTA1P-201ENST00000373793 GGNBP2Q9H3C7 697 aa36.25■■■■□ 3.39
GGTA1P-201ENST00000373793 ARHGEF10O15013 1369 aa36.24■■■■□ 3.39
GGTA1P-201ENST00000373793 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.24■■■■□ 3.39
GGTA1P-201ENST00000373793 NLRP6P59044 892 aa36.24■■■■□ 3.39
GGTA1P-201ENST00000373793 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
GGTA1P-201ENST00000373793 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
GGTA1P-201ENST00000373793 NSD2O96028 1365 aa36.2■■■■□ 3.39
GGTA1P-201ENST00000373793 PLEKHG5O94827 1062 aa36.19■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 NLRP13Q86W25 1043 aa36.19■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 USP31Q70CQ4 1352 aa36.19■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.19■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 COG3Q96JB2 828 aa36.18■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.18■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 USP54Q70EL1 1684 aa36.17■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.17■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.17■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.16■■■■□ 3.38
GGTA1P-201ENST00000373793 SHPRHQ149N8 1683 aa36.12■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 JCADQ9P266 1359 aa36.12■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 MORC1Q86VD1 984 aa36.11■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.11■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 USP19O94966 1318 aa36.1■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.1■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 SOX12O15370 315 aa36.08■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
GGTA1P-201ENST00000373793 SLIT3O75094 1523 aa36.07■■■■□ 3.36
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCA3Q99758 1704 aa36.06■■■■□ 3.36
GGTA1P-201ENST00000373793 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
GGTA1P-201ENST00000373793 GCP02774 474 aa36.03■■■■□ 3.36
GGTA1P-201ENST00000373793 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
GGTA1P-201ENST00000373793 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.03■■■■□ 3.36
GGTA1P-201ENST00000373793 PARD3Q8TEW0 1356 aa36■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 FBLN1P23142 703 aa36■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 NFAT5O94916 1531 aa35.98■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 ANP32CO43423 234 aa35.98■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 RALBP1Q15311 655 aa35.98■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.95■■■■□ 3.35
GGTA1P-201ENST00000373793 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
GGTA1P-201ENST00000373793 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.93■■■■□ 3.34
GGTA1P-201ENST00000373793 LTN1O94822 1766 aa35.93■■■■□ 3.34
GGTA1P-201ENST00000373793 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
GGTA1P-201ENST00000373793 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.9■■■■□ 3.34
GGTA1P-201ENST00000373793 KIAA0232Q92628 1395 aa35.89■■■■□ 3.34
GGTA1P-201ENST00000373793 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.88■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 ADAMTS2O95450 1211 aa35.88■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 PPP2R1AP30153 589 aa35.88■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.88■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 POLKQ9UBT6 870 aa35.87■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 CPDO75976 1380 aa35.86■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.86■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.85■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 LRP6O75581 1613 aa35.85■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 AMPHP49418 695 aa35.83■■■■□ 3.33
GGTA1P-201ENST00000373793 MTHFSP49914 203 aa35.82■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 CHRNA2Q15822 529 aa35.82■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 PEAK1Q9H792 1746 aa35.81■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM83GA6ND36 823 aa35.78■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 COL18A1P39060 1754 aa35.77■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 RTL1A6NKG5 1358 aa35.76■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 FLT4P35916 1363 aa35.76■■■■□ 3.32
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms