RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 ERICH4A6NGS2 130 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 ZMYND15Q9H091 742 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TNMDQ9H2S6 317 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 CBX1P83916 185 aa22.2■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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AMIGO1-202ENST00000369864 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 EID1Q9Y6B2 187 aa22.19■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 SYCE3A1L190 88 aa22.17■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.17■■□□□ 1.14
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AMIGO1-202ENST00000369864 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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AMIGO1-202ENST00000369864 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.16■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 KRT85P78386 507 aa22.16■■□□□ 1.14
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AMIGO1-202ENST00000369864 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.15■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.15■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 SMARCE1Q969G3 411 aa22.15■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 FSD1Q9BTV5 496 aa22.15■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.15■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 STAC3Q96MF2 364 aa22.15■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.15■■□□□ 1.14
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AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
AMIGO1-202ENST00000369864 ERLIN1O75477 346 aa22.14■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.14■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 SKAP1Q86WV1 359 aa22.14■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 ERICH2A1L162 156 aa22.14■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 SERPINC1P01008 464 aa22.14■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA0754O94854 1291 aa22.13■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 STK38Q15208 465 aa22.13■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.12■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.12■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 OFD1O75665 1012 aa22.12■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 WWC1Q8IX03 1113 aa22.12■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 DEF6Q9H4E7 631 aa22.12■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.11■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 UBXN4Q92575 508 aa22.1■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 USP8P40818 1118 aa22.1■■□□□ 1.13
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AMIGO1-202ENST00000369864 WASHC4Q2M389 1173 aa22.09■■□□□ 1.13
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AMIGO1-202ENST00000369864 PRDM2Q13029 1718 aa22.09■■□□□ 1.13
AMIGO1-202ENST00000369864 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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AMIGO1-202ENST00000369864 HFM1A2PYH4 1435 aa22.08■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR63Q8IWG1 891 aa22.08■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 ME1P48163 572 aa22.07■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 HIP1O00291 1037 aa22.07■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP2B1P20020 1258 aa22.06■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.06■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 GNAI2P04899 355 aa22.05■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR97A6NE52 1622 aa22.05■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.05■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.05■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.05■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 SPATA32Q96LK8 384 aa22.05■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKAR2BP31323 418 aa22.05■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TOP2BQ02880 1626 aa22.04■■□□□ 1.12
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AMIGO1-202ENST00000369864 JMYQ8N9B5 988 aa22.04■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 XBP1P17861 261 aa22.04■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 SLFN5Q08AF3 891 aa22.04■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.04■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 AFAP1Q8N556 730 aa22.04■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.04■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CLCN1P35523 988 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 MYO6Q9UM54 1294 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPN14Q15678 1187 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 KDM4AO75164 1064 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP3K11Q16584 847 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC102AQ96A19 550 aa22.03■■□□□ 1.12
AMIGO1-202ENST00000369864 STK3Q13188 491 aa22.03■■□□□ 1.12
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