RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365620.1

RNU6-597P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 597, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-597P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-597P-201ENST00000365620 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 NR3C2P08235 984 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 CLCN1P35523 988 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 PTPRNQ16849 979 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 FOXJ1Q92949 421 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 MAN1A2O60476 641 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 ADH1CP00326 375 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 VSIG8P0DPA2 414 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 ITPKCQ96DU7 683 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 PPFIA3O75145 1194 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 CTHP32929 405 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 PLCB2Q00722 1185 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 KRT76Q01546 638 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 MAP10Q9P2G4 905 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 BMP2P12643 396 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 KCNMA1Q12791 1236 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 MPNDQ8N594 471 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 DNMT3LQ9UJW3 386 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 CFAP99D6REC4 459 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 GRM5P41594 1212 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 MTMR2Q13614 643 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 GDF11O95390 407 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 RASSF7Q02833 373 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 LYPD8Q6UX82 237 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 CABLES1Q8TDN4 633 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 CDK15Q96Q40 435 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-597P-201ENST00000365620 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 AGERQ15109 404 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 DESI1Q6ICB0 168 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 MEIOBQ8N635 442 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 WHAMMQ8TF30 809 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 HRCP23327 699 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 FSHRP23945 695 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 PTSQ03393 145 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 NR5A1Q13285 461 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 TSC1Q92574 1164 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 UPP2O95045 317 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 CBLBQ13191 982 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 SPDYE5A6NIY4 337 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 TTLL8A6PVC2 850 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 IRS1P35568 1242 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 CARD14Q9BXL6 1004 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 SPTLC1O15269 473 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 AMHR2Q16671 573 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 QPCTQ16769 361 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 VWA5B2Q8N398 1253 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 SVOPQ8N4V2 548 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-597P-201ENST00000365620 CDC14CA4D256 554 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZBTB3Q9H5J0 574 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 BARGINQ6ZT62 677 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 SLC35F4A4IF30 521 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-597P-201ENST00000365620 ARHGEF15O94989 841 aa4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.6 ms