RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362821.1

RN7SKP173-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 173, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP173, Length 315 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP173-201ENST00000362821 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.64□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.64□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.63□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.63□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 NME9Q86XW9 330 aa11.63□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 COG3Q96JB2 828 aa11.63□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.63□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIF1AQ12756 1690 aa11.62□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 CFAP53Q96M91 514 aa11.62□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 MST1RQ04912 1400 aa11.61□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 SSH2Q76I76 1423 aa11.61□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 PSME1Q06323 249 aa11.6□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 ORAI2Q96SN7 254 aa11.59□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.59□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.59□□□□□ -0.55
RN7SKP173-201ENST00000362821 MTHFSP49914 203 aa11.58□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 INSRP06213 1382 aa11.57□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.57□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 USP31Q70CQ4 1352 aa11.57□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 FOXO3O43524 673 aa11.57□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.57□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 PIK3C2AO00443 1686 aa11.56□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 ABTB2Q8N961 1025 aa11.56□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 NLRP6P59044 892 aa11.55□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.55□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.54□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.54□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 SLAIN2Q9P270 581 aa11.54□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 NUDCQ9Y266 331 aa11.54□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 USP54Q70EL1 1684 aa11.54□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 POLKQ9UBT6 870 aa11.53□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.53□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
RN7SKP173-201ENST00000362821 SOX12O15370 315 aa11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 BRINP3Q76B58 766 aa11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 SHPRHQ149N8 1683 aa11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.51□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 SBNO1A3KN83 1393 aa11.51□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 FBLN1P23142 703 aa11.5□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.5□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.5□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 PXDNQ92626 1479 aa11.5□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARHGEF10O15013 1369 aa11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 FLT4P35916 1363 aa11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 AMPHP49418 695 aa11.48□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.48□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 ALS2Q96Q42 1657 aa11.48□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 SLIT3O75094 1523 aa11.47□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 NFAT5O94916 1531 aa11.47□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 RTL1A6NKG5 1358 aa11.47□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 USP19O94966 1318 aa11.47□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.47□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.46□□□□□ -0.57
RN7SKP173-201ENST00000362821 PEAK1Q9H792 1746 aa11.46□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 GCP02774 474 aa11.45□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 NGEFQ8N5V2 710 aa11.45□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 RUNDC1Q96C34 613 aa11.45□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.45□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.44□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.44□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 PLEKHG5O94827 1062 aa11.44□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 NEFMP07197 916 aa11.44□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 IL13P35225 146 aa11.44□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.44□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.43□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.43□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 APAF1O14727 1248 aa11.43□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 TOM1O60784 492 aa11.43□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 FCHSD2O94868 740 aa11.43□□□□□ -0.58
RN7SKP173-201ENST00000362821 HOXC9P31274 260 aa11.43□□□□□ -0.58
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